84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3310 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3310  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0070773  hitchhiker  0.0000283034 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3715  hypothetical protein  64.61 
 
 		 188 aa  228  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.000983453  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4386  hypothetical protein  51.61 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.545671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2263  hypothetical protein  51.65 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4247  hypothetical protein  41.57 
 
 		 170 aa  131  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5963  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.05 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.899635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3041  carboxymuconolactone decarboxylase  42.07 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0701219  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3320  carboxymuconolactone decarboxylase  40.85 
 
 		 160 aa  110  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0893741  normal  0.0464114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2799  carboxymuconolactone decarboxylase  40.26 
 
 		 164 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.588172  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2755  carboxymuconolactone decarboxylase  40.26 
 
 		 164 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2785  carboxymuconolactone decarboxylase  40.26 
 
 		 164 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.17 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  30.97 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.11 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.11 
 
 		 283 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.79 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.79 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.79 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.79 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.79 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.79 
 
 		 150 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.81 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.05 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.73 
 
 		 163 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.52 
 
 		 146 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.73 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.6 
 
 		 145 aa  51.2  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.55 
 
 		 180 aa  51.2  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.25 
 
 		 145 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.25 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  29.05 
 
 		 154 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  31.2 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  31.2 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.25 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  31.25 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0598  putative carboxymuconolactone decarboxylase  33.57 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.17953  normal  0.124387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  32.46 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.97 
 
 		 145 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.11 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  31.5 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  31.5 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  28.57 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2738  alkylhydroperoxidase  27.21 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0546441  hitchhiker  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  30.4 
 
 		 145 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  26.49 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.25 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.49 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  28.46 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.15 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.41 
 
 		 145 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.89 
 
 		 152 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  27.73 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  27.15 
 
 		 145 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.2 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2089  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.92 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  28.06 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.67 
 
 		 159 aa  44.7  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  26.52 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  26.49 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  29.73 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1766  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.59 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.472183 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.21 
 
 		 144 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2472  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.44 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  31.45 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  27.21 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  29.73 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2761  carboxymuconolactone decarboxylase  27.59 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  32.03 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3926  carboxymuconolactone decarboxylase  37.31 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.65 
 
 		 159 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3826  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.97 
 
 		 141 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0091  alkylhydroperoxidase-related  27.11 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336937  normal  0.314057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3440  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.37 
 
 		 152 aa  41.2  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  22.76 
 
 		 153 aa  41.2  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  28.31 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1837  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  65.52 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01722  hypothetical protein  65.52 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01710  hypothetical protein  65.52 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1879  carboxymuconolactone decarboxylase  65.52 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1889  Carboxymuconolactone decarboxylase  65.52 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0189172  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1976  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  65.52 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2002  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  65.52 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.52682  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1437  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  65.52 
 
 		 182 aa  40.8  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.355525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>