111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2661 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  249  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2721  PilT protein-like protein  49.19 
 
 		 125 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  44.27 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  44.27 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  42.19 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  41.41 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  41.41 
 
 		 133 aa  90.5  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0091  PilT domain-containing protein  37.69 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  41.41 
 
 		 133 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  36.72 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  34.85 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0728  PilT protein domain protein  36.15 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.741529  hitchhiker  0.0000801582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  37.4 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  39.23 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  37.4 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3682  PilT domain-containing protein  37.69 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.362926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3905  PilT domain-containing protein  36.57 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646522  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  33.08 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  40.31 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3757  PilT domain-containing protein  36.84 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272094  normal  0.0228653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0478  virulence-associated protein, putative  33.08 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8106  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0638  PilT protein domain protein  32.33 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  37.59 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  32.58 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  32.58 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  32.82 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0152  PilT protein domain protein  36.09 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  34.11 
 
 		 141 aa  70.1  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0286  PilT protein domain protein  31.58 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.024358  decreased coverage  0.0024847 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  36.64 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  32.82 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  38.46 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3988  PilT protein domain protein  30.83 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0532731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  37.4 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3939  PilT protein domain protein  33.83 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2127  vapC protein, putative  31.78 
 
 		 133 aa  67  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  33.33 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  32.82 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1067  PilT protein domain protein  33.83 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  32.82 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  35.16 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  32.82 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0156  PilT protein domain protein  35.16 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5055  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4187  DNA replication protein-like protein  32.82 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  37.88 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  33.59 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  30.83 
 
 		 132 aa  62  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  32.03 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1876  PilT protein domain protein  33.86 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  32.12 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1627  PilT protein domain protein  35.11 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.733144  normal  0.420461 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1533  PilT protein domain protein  33.59 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0497484  hitchhiker  0.000597174 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  28.79 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2366  PilT protein domain protein  33.58 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4014  PilT protein domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00102621  hitchhiker  0.000259631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  32.06 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  33.08 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4076  plamid maintenance protein  31.65 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  32.33 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  31.06 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2468  PilT protein domain protein  31.34 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03915  predicted nucleic acid-binding protein,contains PIN domain  36.36 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.968864  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2655  PIN domain protein  31.62 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2597  PilT protein-like protein  35.94 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2281  PilT protein domain protein  30.97 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.913458  hitchhiker  0.0000308693 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2552  PilT domain-containing protein  37.78 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.748536  normal  0.0339823 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3968  PilT domain-containing protein  30.77 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.10464  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6178  PilT protein, N-terminal  31.82 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2936  PilT domain-containing protein  36.15 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.203821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  28.68 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  28.24 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3461  PilT domain-containing protein  29.23 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.999718 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0420  PilT protein domain protein  30 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1433  NtrR protein  28.79 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1138  PilT domain-containing protein  32.58 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0155  PilT protein domain protein  32.86 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.538447 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0038  PilT domain-containing protein  32.85 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2826  PilT protein-like  33.85 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.640016  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3124  hypothetical protein  27.97 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.864245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2620  PilT protein domain protein  30.65 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  29.41 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0701  PilT protein domain protein  26.32 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.528227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4600  putative nitrogen regulatory protein (NtrR-like), putative virulence associated protein (vap)  36.92 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.660475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1566  PilT domain-containing protein  31.62 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123163  normal  0.225999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1632  PilT protein domain protein  26.62 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4589  PilT protein domain protein  25.53 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000022459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0234  PilT domain-containing protein  32.84 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749646 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2391  PIN (PilT N terminus) domain  29.03 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  34.33 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1545  PilT domain-containing protein  30.88 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.230093  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1606  PilT protein domain protein  26.62 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1362  plasmid stability protein, putative  45.9 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00298137  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  34.07 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4437  PilT protein-like  33.59 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0151  PilT protein domain protein  27.27 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.85559  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  41.27 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1389  nucleic acid binding protein  28.93 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0940077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>