More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1211 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  831    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  53.04 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  51.68 
 
 		 427 aa  363  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  52.12 
 
 		 428 aa  358  8e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  49.02 
 
 		 415 aa  345  8.999999999999999e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 		 416 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  49.39 
 
 		 432 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  49.39 
 
 		 432 aa  336  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  48.4 
 
 		 419 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  47.29 
 
 		 415 aa  332  8e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  50.12 
 
 		 424 aa  322  6e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 479 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 403 aa  318  9e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  49.16 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  46.08 
 
 		 406 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 		 440 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  45.59 
 
 		 420 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  50.56 
 
 		 360 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  46.08 
 
 		 406 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  47.99 
 
 		 406 aa  306  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  44.06 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  48.76 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  45.17 
 
 		 405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  45.43 
 
 		 410 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  50 
 
 		 411 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  47.67 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  45.59 
 
 		 420 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 421 aa  299  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 416 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  45.83 
 
 		 403 aa  297  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  45.34 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 406 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 416 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 409 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  47.89 
 
 		 413 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  46.19 
 
 		 403 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  46.04 
 
 		 406 aa  292  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 416 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 406 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 418 aa  289  8e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  47.49 
 
 		 423 aa  286  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  47.04 
 
 		 416 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 408 aa  286  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 408 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 408 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  45.54 
 
 		 408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  44.47 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  46.63 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  40.33 
 
 		 433 aa  276  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  46.21 
 
 		 412 aa  275  8e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  39.67 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  48.31 
 
 		 415 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  45.32 
 
 		 412 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  44.83 
 
 		 416 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 		 397 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  45.72 
 
 		 421 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  42.05 
 
 		 454 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  36.34 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  37.44 
 
 		 427 aa  243  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  41.83 
 
 		 399 aa  239  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 457 aa  239  9e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  39.9 
 
 		 499 aa  237  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  40.18 
 
 		 455 aa  236  8e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 		 418 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 425 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 401 aa  226  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 416 aa  226  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  36.96 
 
 		 427 aa  219  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  40.51 
 
 		 421 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 428 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  40.29 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 415 aa  206  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 401 aa  204  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  38.9 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  39.32 
 
 		 410 aa  200  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 524 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  34.61 
 
 		 414 aa  196  1e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  35.41 
 
 		 407 aa  193  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 414 aa  179  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 449 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 412 aa  126  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 438 aa  126  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 447 aa  123  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.98 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>