More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1027 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1027  cytochrome P450  100 
 
 
418 aa  857    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0325234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  31.73 
 
 
422 aa  173  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  31.47 
 
 
401 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  30.05 
 
 
407 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  31.02 
 
 
402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  31.4 
 
 
402 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  30.55 
 
 
414 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  29.27 
 
 
408 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  28.43 
 
 
426 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  30.13 
 
 
417 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0029  cytochrome P450  28.93 
 
 
417 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0792311  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  29.62 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  30.33 
 
 
400 aa  156  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  28.43 
 
 
410 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  27.32 
 
 
420 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  31.41 
 
 
411 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  29 
 
 
408 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  28.93 
 
 
401 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  28.61 
 
 
411 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  29.48 
 
 
387 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  27.7 
 
 
399 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  30.9 
 
 
408 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  30.42 
 
 
412 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  29.11 
 
 
423 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  30.15 
 
 
398 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  29.01 
 
 
392 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  28.86 
 
 
403 aa  150  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  28.93 
 
 
405 aa  149  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  28.57 
 
 
410 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  28.47 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  28.23 
 
 
411 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  28.47 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  28.47 
 
 
411 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  28.88 
 
 
420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  28.23 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  28.57 
 
 
410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  27.76 
 
 
411 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0600  cytochrome P450  27.53 
 
 
470 aa  146  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  29.59 
 
 
421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0166  cytochrome P450  30.23 
 
 
401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  29.32 
 
 
938 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  27.27 
 
 
411 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  28.5 
 
 
429 aa  145  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  29.78 
 
 
430 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  30.4 
 
 
419 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0290  putative cytochrome P450  28.39 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  28.73 
 
 
411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  31.18 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  27.82 
 
 
398 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  29.37 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  29.37 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4405  cytochrome P450  27.3 
 
 
447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4449  cytochrome P450  28.06 
 
 
398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  28.74 
 
 
407 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  30.11 
 
 
400 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  28.74 
 
 
407 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13551  cytochrome P450 monooxygenase 142 cyp142  30.09 
 
 
398 aa  140  6e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000578642  hitchhiker  0.0000082188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  28.74 
 
 
407 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  29.37 
 
 
436 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5035  cytochrome P450  29.66 
 
 
424 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.854522  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  29.82 
 
 
419 aa  139  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4652  cytochrome P450  29.66 
 
 
424 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.828296  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4740  cytochrome P450  29.66 
 
 
424 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.59592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  28.15 
 
 
423 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  26.56 
 
 
411 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  30.24 
 
 
412 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  26.79 
 
 
411 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  28.75 
 
 
399 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  30.08 
 
 
396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  29.51 
 
 
413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1544  cytochrome P450  27.25 
 
 
418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  29.53 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0020  cytochrome P450  29.74 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0467456  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  31.12 
 
 
412 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  30.11 
 
 
394 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  28.89 
 
 
421 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2520  putative cytochrome P450  28.12 
 
 
399 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.902578  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  29.57 
 
 
403 aa  136  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  27.93 
 
 
414 aa  135  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1095  cytochrome P450  27.48 
 
 
414 aa  135  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0869  cytochrome P450  27.11 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  27.03 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  30.36 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  27.14 
 
 
405 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1694  cytochrome P450 hydroxylase  27.14 
 
 
414 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  28.99 
 
 
423 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  29.87 
 
 
388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17810  cytochrome P450  26.17 
 
 
423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.859475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  27.05 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  26.8 
 
 
414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  27.2 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  28.86 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2116  cytochrome P450  29.32 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  26.5 
 
 
429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  30.48 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  26.81 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  30.84 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  28.61 
 
 
406 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  29.24 
 
 
395 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0012  cytochrome P450  28.47 
 
 
422 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.469662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>