More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0583 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  100 
 
 		 191 aa  375  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  58.38 
 
 		 222 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  57.3 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  37.04 
 
 		 186 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  35.9 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  42.08 
 
 		 203 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  37.91 
 
 		 182 aa  114  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  36.41 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  35.11 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  35.38 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  35.11 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  35.38 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  35.38 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.25 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  36.21 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  37.7 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  35.26 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  37.3 
 
 		 186 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  37.23 
 
 		 197 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.72 
 
 		 184 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  38.04 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  37.99 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  36.07 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  33.33 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  36.41 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  34.72 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  36.31 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  38.25 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  32.97 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  39.01 
 
 		 178 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  36.81 
 
 		 188 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  36.81 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  36.81 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  36.02 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  35.11 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  31.77 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  36.84 
 
 		 441 aa  97.1  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  40.82 
 
 		 416 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  39.47 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  37.37 
 
 		 187 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  36.81 
 
 		 190 aa  95.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  39.25 
 
 		 188 aa  95.1  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  34.62 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  40 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  34.43 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  34.44 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  34.66 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  35.87 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  40.76 
 
 		 421 aa  91.7  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  36.9 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  34.07 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  39.34 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.44 
 
 		 183 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  33.33 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  34.44 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  34.44 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  31.87 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  37.37 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  36.72 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  30.43 
 
 		 178 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  33.87 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  38.3 
 
 		 406 aa  85.5  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  33.87 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  36.81 
 
 		 174 aa  84.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  29.63 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  29.57 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  33.51 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  32.26 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  32.8 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7458  cytochrome B561  33.89 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  33.86 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  33.86 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  31.94 
 
 		 175 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  28.65 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  33.72 
 
 		 190 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  31.46 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  35.14 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  36.96 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  37.16 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  37.16 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  37.16 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  37.16 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  37.97 
 
 		 420 aa  78.6  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  37.16 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  37.16 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  37.16 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  30.77 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  33.86 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  31.72 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  29.47 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1313  cytochrome B561  34.46 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169075  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  35.48 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  36.26 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  31.87 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  31.55 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  33.86 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1004  cytochrome B561  36.63 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>