More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34410 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34410  ABC-type enterochelin transport system, permease component  100 
 
 		 336 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0020  transport system permease protein  70.73 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5027  transport system permease protein  65.76 
 
 		 344 aa  348  8e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.503728  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3786  transport system permease protein  60.4 
 
 		 335 aa  345  8e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2367  transport system permease protein  57.05 
 
 		 346 aa  322  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.711313  normal  0.0413639 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0676  iron compound ABC transporter, permease protein  58.42 
 
 		 320 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0633  iron compound ABC transporter, permease protein  58.42 
 
 		 320 aa  320  3e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3798  transport system permease protein  56.44 
 
 		 320 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06134  ABC-type enterochelin transport system permease  49.66 
 
 		 311 aa  302  6.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0299  transport system permease protein  55.87 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1351  enterochelin ABC transporter, permease protein  44.62 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1541  enterochelin ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.567393  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4092  iron chelate ABC transporter, permease protein  50.31 
 
 		 319 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.664807  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4144  iron chelate ABC transporter permease  50.31 
 
 		 319 aa  299  6e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880665  normal  0.0124759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0070  transport system permease protein  50.31 
 
 		 319 aa  299  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4397  transport system permease protein  53.56 
 
 		 325 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1000  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  47.71 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000321439  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2403  transport system permease protein  54.68 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0598875  hitchhiker  0.0045509 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000331  iron(III) ABC transporter permease protein  46.39 
 
 		 289 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000524649  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1394  transport system permease protein  52.26 
 
 		 344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0453205  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1764  transport system permease protein  51.5 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.218639  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2626  transport system permease protein  50.85 
 
 		 325 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2036  transport system permease protein  51.5 
 
 		 319 aa  275  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1112  iron chelate ABC transporter, permease protein  47.81 
 
 		 318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  41.91 
 
 		 320 aa  272  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1010  iron compound ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 		 320 aa  266  5e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0653713  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0774  transport system permease protein  41.08 
 
 		 323 aa  263  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.848187  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0757  transport system permease protein  41.08 
 
 		 323 aa  263  4.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1908  transport system permease protein  43.84 
 
 		 368 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  0.119635 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0660  transport system permease protein  50.55 
 
 		 352 aa  261  2e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1006  transport system permease protein  48.17 
 
 		 349 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  46.15 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.279632  normal  0.137174 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0400  iron compound ABC transporter, permease protein  41.61 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1629  transport system permease protein  38.96 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.287852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16590  ABC-type enterochelin transport system, permease component  42.99 
 
 		 352 aa  249  6e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1931  transport system permease protein  43 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.109589 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3220  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  52.82 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.436019  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2662  transport system permease protein  42.28 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0359  transport system permease protein  38.85 
 
 		 278 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00496311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3669  transport system permease protein  38.33 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3470  transport system permease protein  38.33 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4952  iron compound ABC transporter permease  41.72 
 
 		 338 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5329  iron compound ABC transporter permease protein  41.72 
 
 		 334 aa  243  5e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0318732  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30530  ABC-type enterochelin transport system, permease component  46.32 
 
 		 336 aa  242  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0635  transport system permease protein  38.94 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000008766  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4814  iron compound ABC transporter, permease  40.6 
 
 		 338 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.216332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5233  iron compound ABC transporter, permease protein  40.6 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4794  iron compound ABC transporter, permease  40.6 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000637239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3343  transport system permease protein  38 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.199124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5225  iron compound ABC transporter, permease protein  41.38 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2915  transport system permease protein  38.76 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0212375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2664  transport system permease protein  43.89 
 
 		 322 aa  238  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2594  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  45.77 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0873282  normal  0.0594882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4917  transport system permease protein  41.38 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5196  iron compound ABC transporter, permease protein  42.07 
 
 		 280 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0008  iron compound ABC transporter, permease protein  42.44 
 
 		 282 aa  236  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3959  transport system permease protein  51.76 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5246  iron compound ABC transporter, permease protein  42.97 
 
 		 280 aa  233  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1028  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.11 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000116719  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02108  hypothetical protein  39.6 
 
 		 314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3703  transport system permease protein  49.47 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.162159  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25340  ABC-type enterochelin transport system, permease component  44.48 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4265  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  50.19 
 
 		 274 aa  216  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  30.77 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  31.96 
 
 		 349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  30.57 
 
 		 348 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  30.25 
 
 		 348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  30.9 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  33.33 
 
 		 370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  29.25 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  31.76 
 
 		 357 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  30.89 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3904  transport system permease protein  28.67 
 
 		 350 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  29.46 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  30.87 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  30.03 
 
 		 329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2408  transport system permease protein  27.08 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00436362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  29.63 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0808  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuB  28.43 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0795  iron compound ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0863815  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5176  transport system permease protein  27.37 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  34.38 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5506  iron compound ABC transporter, permease protein  27.37 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5512  iron compound ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5063  ferrichrome ABC transporter, permease  27.08 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5080  ferrichrome transport system, permease  27.08 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  31.62 
 
 		 354 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5445  iron compound ABC transporter, permease protein  27.37 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5475  iron compound ABC transporter, permease protein  27.08 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0329  transport system permease protein  27.06 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00182989  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  27.85 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  28.28 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5561  iron compound ABC transporter, permease protein  26.74 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  25.97 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1104  iron-hydroxamate transporter permease subunit  33.8 
 
 		 694 aa  113  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  28.7 
 
 		 336 aa  113  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  32.18 
 
 		 358 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  30.2 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  29.26 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>