More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_33530  cytochrome P450  100 
 
 
410 aa  833    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.101916  normal  0.234343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1433  Cytochrome P450-like protein  46.31 
 
 
424 aa  352  7e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.667112  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4334  putative cytochrome P450  39.64 
 
 
484 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.686964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1142  putative cytochrome P450  39.84 
 
 
421 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15529  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2803  putative cytochrome P450-family protein  37.73 
 
 
414 aa  252  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348302  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2751  putative cytochrome P450-family protein  38.56 
 
 
426 aa  251  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.581871  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4812  cytochrome P450-family protein  38.12 
 
 
446 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5490  putative cytochrome P450  36.57 
 
 
437 aa  233  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0347822  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5491  putative cytochrome P450  35.96 
 
 
488 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.767325  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2975  putative cytochrome P450  34.68 
 
 
452 aa  213  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4556  putative cytochrome P450  33.77 
 
 
442 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4583  putative cytochrome P450  34.79 
 
 
471 aa  206  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4184  cytochrome P450 monooxygenase  33.5 
 
 
406 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.1685  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4420  putative cytochrome P450  33.95 
 
 
440 aa  194  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1747  putative cytochrome P450  32.37 
 
 
454 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0264528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2597  Cytochrome P450  32.72 
 
 
500 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal  0.048774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2802  putative cytochrome P450  30.15 
 
 
409 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4949  cytochrome P450  31.46 
 
 
412 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2724  cytochrome P450  31.15 
 
 
409 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.118546  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3959  Cytochrome P450-like protein  30.85 
 
 
465 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  29.77 
 
 
412 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  28.02 
 
 
411 aa  136  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  29.29 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  29.85 
 
 
411 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1748  cytochrome P450-family protein  29.69 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.794769  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  30.43 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4555  cytochrome P450  32.28 
 
 
366 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2750  cytochrome P450  26.8 
 
 
416 aa  127  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6983  cytochrome P450-family protein  27.03 
 
 
416 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.264455  normal  0.355238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  27.82 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  26.51 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  28.82 
 
 
398 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  30.79 
 
 
418 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  28.89 
 
 
411 aa  119  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  27.82 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4942  cytochrome P450  29.02 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1259  cytochrome P450  29.69 
 
 
422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  26.11 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3146  cytochrome P450  29.17 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  26.67 
 
 
411 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1904  cytochrome P450  27.85 
 
 
400 aa  116  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0311856  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5282  cytochrome P450  27.04 
 
 
424 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  28.77 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3277  cytochrome P450  29.79 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.810975  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  28.9 
 
 
399 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  26.85 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  26.85 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  26.67 
 
 
411 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  28.61 
 
 
420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  27.16 
 
 
426 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3576  cytochrome P450  28.46 
 
 
439 aa  113  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  26.6 
 
 
411 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  26.07 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3656  cytochrome P450  27.69 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.300661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  29.31 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  27.69 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  29.23 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  26.84 
 
 
405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  27.81 
 
 
400 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  28.46 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  26.24 
 
 
408 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  27.78 
 
 
414 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  24 
 
 
420 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  26.07 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  28.18 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  28.18 
 
 
404 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  27.89 
 
 
423 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1432  cytochrome P450  28.13 
 
 
408 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.675359  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  25.27 
 
 
410 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3008  cytochrome P450  27.95 
 
 
401 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  26.73 
 
 
409 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  26.47 
 
 
411 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26970  cytochrome P450  27.93 
 
 
405 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.836676  normal  0.413718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  29.94 
 
 
407 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  27.83 
 
 
399 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  29.07 
 
 
394 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  27.2 
 
 
409 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4185  cytochrome P450  27.06 
 
 
412 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059363  normal  0.410694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  27.48 
 
 
402 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8715  cytochrome P450-family protein  26.73 
 
 
409 aa  106  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4832  cytochrome P450  26.85 
 
 
408 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  27.54 
 
 
400 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  26.85 
 
 
403 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3533  cytochrome P450  28.99 
 
 
432 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173576  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  29.62 
 
 
406 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  28.14 
 
 
398 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  29 
 
 
405 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  29.87 
 
 
417 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3776  cytochrome P450  26.68 
 
 
413 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  28.02 
 
 
407 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  28.02 
 
 
407 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  26.94 
 
 
409 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  26.78 
 
 
401 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  28.02 
 
 
392 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  27.32 
 
 
402 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4689  cytochrome P450  26.77 
 
 
402 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  28.02 
 
 
407 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  27.67 
 
 
400 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2746  cytochrome P450  27.79 
 
 
391 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.136535  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  25.94 
 
 
411 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>