More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19440 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 421 aa  820    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  48.19 
 
 		 414 aa  343  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  47.93 
 
 		 414 aa  342  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  48.19 
 
 		 394 aa  342  7e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  48.18 
 
 		 390 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  48.18 
 
 		 390 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  47.92 
 
 		 390 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  48.18 
 
 		 390 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  47.92 
 
 		 390 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 431 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  48.18 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37440  putative MFS transporter  39.61 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0453778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4572  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3516  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.842174  normal  0.311663 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4359  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4007  major facilitator transporter  37.86 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3490  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16107  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2076  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 393 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0274454  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  31.77 
 
 		 397 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6200  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 409 aa  169  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 396 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0032  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 390 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  29.83 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  33.24 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  30.79 
 
 		 387 aa  162  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 406 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  29.97 
 
 		 395 aa  159  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 395 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1620  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51408  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  33.51 
 
 		 383 aa  154  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1829  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.843072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 408 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  31.98 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  30.35 
 
 		 388 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  30.35 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  30.35 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  30.7 
 
 		 407 aa  149  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4660  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.37515  hitchhiker  0.00979921 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  30.13 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  30.62 
 
 		 391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  28.18 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  28.18 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  28.18 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 415 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  30.08 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  28.18 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  26.34 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 391 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2036  major facilitator superfamily protein  29.32 
 
 		 392 aa  146  8.000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.539709  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0049  arabinose efflux permease  29.84 
 
 		 395 aa  146  8.000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  26.42 
 
 		 404 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  26.42 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  30.59 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0075  arabinose efflux permease  29.92 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.761215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  33.72 
 
 		 389 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  26.22 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1603  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 386 aa  143  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000182217  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 405 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 389 aa  143  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 385 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 389 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 416 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  26.74 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1672  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000335684  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3163  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  33.14 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  33.14 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5072  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5205  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0237858 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  30.08 
 
 		 400 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0797  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 411 aa  139  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 388 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  29.38 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>