More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18330  uncharacterized membrane-associated protein  100 
 
 		 230 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0828  membrane protein, DedA family  53.4 
 
 		 218 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5678  SNARE associated Golgi protein  43.81 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10410  uncharacterized membrane-associated protein  42.78 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.644792  normal  0.0211911 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3131  hypothetical protein  36.99 
 
 		 471 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  31.91 
 
 		 363 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  33.86 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  35.57 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  32.02 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  33.82 
 
 		 203 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3359  SNARE associated Golgi protein  35.75 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.703803  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.08 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.32 
 
 		 458 aa  82  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1764  SNARE associated Golgi protein  35.03 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000231934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1554  hypothetical protein  36.65 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  29.13 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  27.8 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000116146 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  30.98 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  33.15 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  33.15 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  33.15 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  31.47 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.32 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4526  hypothetical protein  36.9 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  30.43 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  30.43 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  30.43 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  30.43 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.28 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  28.42 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  28.57 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  34.24 
 
 		 202 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  31.47 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  33.14 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  29.89 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  32.07 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1922  hypothetical protein  27.07 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000155723  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1229  hypothetical protein  30.59 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.119294  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  27.64 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  29.57 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  29.89 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  29.89 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0526  SNARE associated Golgi protein  30.43 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.115863  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  29.89 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  32.39 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  29.89 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  29.89 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  29.89 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  25.27 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  28.64 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  27.62 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  27.46 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  38.55 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  34.9 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  29.41 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  26.98 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2060  hypothetical protein  37.24 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00249342  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  28.9 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  31.08 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  31.21 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  32.49 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  27.01 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  29.79 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.51 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1368  integral membrane protein  27.17 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0579  SNARE associated Golgi protein  27.57 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0431109  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1818  SNARE associated Golgi protein  34.27 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.685944  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  34 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1299  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.724707  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  29.66 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  28.57 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  26.63 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  30.41 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1653  SNARE associated Golgi protein  27.27 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  25 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  32.86 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0565  SNARE associated Golgi protein  30.3 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000222667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  33.49 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  27.62 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03490  uncharacterized membrane-associated protein  30.36 
 
 		 216 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3351  SNARE associated Golgi protein  28.82 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.194662  hitchhiker  0.00788727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  32.61 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0210  hypothetical protein  24.59 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  27 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1883  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.97 
 
 		 702 aa  66.6  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.379542  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  28.47 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  27.44 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  23.74 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  28.72 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  25.82 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  28.72 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  27.72 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  29.28 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  26.16 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  28.64 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0508  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.5 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.63 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  28.47 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.04 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  27.17 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>