130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1760 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  100 
 
 
171 aa  352  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  55.83 
 
 
164 aa  198  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  58.9 
 
 
164 aa  198  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  55.69 
 
 
167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  57.06 
 
 
164 aa  195  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  56.1 
 
 
164 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  57.93 
 
 
164 aa  195  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  57.06 
 
 
164 aa  192  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  54.49 
 
 
167 aa  191  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  55.35 
 
 
164 aa  189  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  53.66 
 
 
165 aa  189  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  53.89 
 
 
167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  53.46 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  51.33 
 
 
167 aa  133  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  31.37 
 
 
181 aa  88.2  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  32.62 
 
 
191 aa  87.4  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  33.08 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  31.72 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 
185 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  32.12 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  32.12 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  32.5 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  30.87 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  30.2 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  31.39 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  32.12 
 
 
194 aa  74.3  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  30.34 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  32.86 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  32.86 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  26.9 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  32.86 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  32.86 
 
 
176 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  30.99 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  28.99 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  32.67 
 
 
195 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  33.1 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  27.97 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  29.71 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  33.1 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  30.77 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  29.2 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  29.3 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  27.94 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  30.56 
 
 
257 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  29.3 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  27.34 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  31.72 
 
 
190 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  30.28 
 
 
138 aa  61.6  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  29.3 
 
 
183 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  27.39 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  31.72 
 
 
190 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  28.76 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  28.76 
 
 
182 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4488  Ferritin Dps family protein  31.34 
 
 
165 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  0.883174 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0254  Rubrerythrin  30.37 
 
 
170 aa  54.7  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  27.46 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  30.77 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  27.81 
 
 
167 aa  51.6  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  40.58 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  28.26 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  29.03 
 
 
155 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  30.07 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1247  bacterioferritin  25.37 
 
 
158 aa  48.5  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0605  Ferritin Dps family protein  27.61 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  27.03 
 
 
154 aa  47.8  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  30.94 
 
 
179 aa  47.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0321  bacterioferritin  29.5 
 
 
157 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  29.63 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  30.22 
 
 
154 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  32.84 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  32.35 
 
 
154 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  26.67 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  31.43 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  28.57 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  30.22 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  30.43 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  40 
 
 
199 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  35.71 
 
 
179 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  31.39 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  31.39 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  36.23 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  31.39 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2818  bacterioferritin  29.5 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  27.34 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0062  Ferritin and Dps  37.84 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00686559 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1369  bacterioferritin  28.06 
 
 
159 aa  44.7  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  32.09 
 
 
158 aa  44.7  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  31.54 
 
 
172 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  35.29 
 
 
157 aa  44.3  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  30.66 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0346  bacterioferritin  29.85 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.934014  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  28.77 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  29.32 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  28.47 
 
 
160 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  27.89 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1387  Ferritin Dps family protein  27.41 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00351498  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  27.03 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0971213 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>