210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1238 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1238  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 
183 aa  375  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1132  thiamine monophosphate synthase  47.54 
 
 
185 aa  171  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0773  thiamine monophosphate synthase  39.01 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.158421  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1173  Thiamine-phosphate diphosphorylase  42.52 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0370  Thiamine-phosphate diphosphorylase  43.55 
 
 
183 aa  77.4  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380325  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1006  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.15 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  29.89 
 
 
314 aa  68.6  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.68 
 
 
344 aa  67.8  0.00000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.89 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  31.65 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0210  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  29.95 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0218369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  33.12 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.72 
 
 
218 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0815  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  30.18 
 
 
224 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.339712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1569  thiamine monophosphate synthase family protein  32.5 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.269331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1618  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.95 
 
 
199 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1348  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.81 
 
 
206 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0984  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase protein  26.37 
 
 
198 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.462651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28 
 
 
220 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1283  Thiamine-phosphate diphosphorylase  34.45 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.8635  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  27.03 
 
 
318 aa  60.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1337  Thiamine-phosphate diphosphorylase  29.1 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397681  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.94 
 
 
216 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  26.34 
 
 
317 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0959  thiamine-phosphate pyrophosphorylase, putative  29.07 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.277889  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37 
 
 
223 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1405  thiamine monophosphate synthase  30.33 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1691  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.3 
 
 
209 aa  58.9  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0247781  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2516  thiamine-phosphate diphosphorylase  29.1 
 
 
203 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138551  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1375  thiamine monophosphate synthase  28.21 
 
 
218 aa  58.9  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.04 
 
 
215 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0607  thiamin biosynthesis protein  34.62 
 
 
208 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.380998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.26 
 
 
252 aa  58.2  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  32.67 
 
 
314 aa  57.8  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1852  thiamine monophosphate synthase family protein  37.62 
 
 
193 aa  57.8  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.01 
 
 
223 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1745  thiamine monophosphate synthase  29.61 
 
 
211 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.211367  normal  0.0155398 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.71 
 
 
220 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1606  phosphomethylpyrimidine kinase / thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.46 
 
 
532 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.41103  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1435  Thiamine-phosphate diphosphorylase  30.91 
 
 
203 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00770563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.54 
 
 
206 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  27.94 
 
 
319 aa  55.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.27 
 
 
210 aa  55.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0276  hypothetical protein  27.33 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.714214 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1499  thiamine monophosphate synthase  28.49 
 
 
215 aa  55.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.76 
 
 
216 aa  55.1  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.31 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1284  thiamine monophosphate synthase  31.45 
 
 
202 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.41 
 
 
216 aa  55.1  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0645  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.14 
 
 
216 aa  54.7  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  28.79 
 
 
212 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  34.45 
 
 
497 aa  54.7  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.41 
 
 
211 aa  54.3  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1996  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 
352 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1918  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.65 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.59 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0587  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.81 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.819904  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  31.36 
 
 
306 aa  53.1  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  35 
 
 
484 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.81 
 
 
220 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  34.53 
 
 
484 aa  52.4  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.3 
 
 
350 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.84 
 
 
346 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1683  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  28.57 
 
 
218 aa  51.6  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000047745  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5033  thiamine monophosphate synthase  32.26 
 
 
201 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.519144 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.58 
 
 
217 aa  51.6  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.56 
 
 
211 aa  51.2  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE, putative  33.33 
 
 
196 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.58 
 
 
221 aa  51.2  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3677  thiamine monophosphate synthase  34.52 
 
 
194 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.62971  normal  0.140239 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4514  thiamine monophosphate synthase  34.52 
 
 
194 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3850  thiamine monophosphate synthase  34.52 
 
 
194 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.55 
 
 
219 aa  51.2  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0610  transcriptional regulator TenI  28.67 
 
 
202 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0287  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  35.44 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.519508  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0878  dGTP-pyrophosphohydrolase; thiamine phosphate synthase  35.44 
 
 
196 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  29.73 
 
 
321 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  29.33 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.82 
 
 
343 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.17 
 
 
343 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000869  thiamin-phosphate pyrophosphorylase  30.77 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0093  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000282535  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0319  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  35.44 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2056  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.43 
 
 
216 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.343455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0075  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37 
 
 
222 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2440  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  35.44 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0081  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.58 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.25 
 
 
360 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1467  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  35.44 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.04 
 
 
228 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1664  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase ThiE  35.44 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2576  thiamine monophosphate synthase  33.01 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.25 
 
 
350 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  28.23 
 
 
320 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  27.74 
 
 
365 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2953  thiamine monophosphate synthase  28.46 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  27.42 
 
 
320 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1175  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.22 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  32.73 
 
 
492 aa  48.9  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  35.14 
 
 
314 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>