More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1398 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1398  CinA domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  329  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.6257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1356  CinA domain-containing protein  85.45 
 
 		 177 aa  256  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25150  competence/damage-inducible protein cinA  54.78 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  54.25 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  57.82 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  54.05 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2396  CinA domain-containing protein  54.36 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5798  CinA domain protein  55.86 
 
 		 203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1097  CinA domain-containing protein  51.35 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal  0.063804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2175  competence/damage-inducible protein cinA  52.38 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3538  competence/damage-inducible protein cinA  49.66 
 
 		 433 aa  126  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.278952  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2809  CinA domain protein  63.93 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012503  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  51.28 
 
 		 170 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2111  CinA domain-containing protein  50.68 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0706668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2124  CinA-like protein  50.68 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2170  CinA domain-containing protein  50.68 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.391062  normal  0.424185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  51.63 
 
 		 432 aa  120  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17980  competence/damage-inducible protein cinA  49.01 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0541043  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4260  CinA domain-containing protein  49.67 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0984245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1497  competence/damage-inducible protein cinA  51.09 
 
 		 427 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.931703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  51.49 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1207  competence/damage-inducible protein CinA  50.99 
 
 		 438 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.016582  normal  0.634024 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2456  CinA domain protein  49.65 
 
 		 166 aa  114  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  44.74 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  44.1 
 
 		 413 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1036  CinA domain protein  47.59 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  42.67 
 
 		 413 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1538  CinA domain protein  52.67 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14327  normal  0.204129 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  43.42 
 
 		 413 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  44.2 
 
 		 411 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  44.24 
 
 		 432 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  47.85 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  41.22 
 
 		 416 aa  104  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1086  CinA domain-containing protein  45.88 
 
 		 165 aa  104  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1466  competence/damage-inducible protein CinA  45.18 
 
 		 425 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.95 
 
 		 424 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  43.62 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  43.04 
 
 		 413 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  34.1 
 
 		 415 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  42.18 
 
 		 413 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1563  CinA domain protein  43.1 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5905  competence/damage-inducible protein CinA  42.86 
 
 		 437 aa  101  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1237  CinA domain protein  59.83 
 
 		 161 aa  101  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  46.05 
 
 		 420 aa  100  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0627  competence/damage-inducible protein CinA  44.59 
 
 		 417 aa  100  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  44.05 
 
 		 179 aa  100  9e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.5 
 
 		 433 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2324  competence/damage-inducible protein cinA  46.21 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700413  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3244  competence/damage-inducible protein CinA  44.44 
 
 		 447 aa  99.4  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0952276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  44.52 
 
 		 414 aa  99  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  41.89 
 
 		 415 aa  99  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  42.07 
 
 		 419 aa  98.2  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1118  CinA domain protein  45.68 
 
 		 181 aa  98.2  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  43.84 
 
 		 414 aa  97.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  45.89 
 
 		 218 aa  97.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  36.99 
 
 		 408 aa  97.1  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  42.07 
 
 		 414 aa  97.1  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  49.02 
 
 		 410 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  33.76 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  39.74 
 
 		 415 aa  96.7  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2617  CinA domain protein  43.9 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  41.43 
 
 		 186 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  38.3 
 
 		 411 aa  95.9  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  41.55 
 
 		 420 aa  95.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.18 
 
 		 431 aa  94.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  36.88 
 
 		 408 aa  94.7  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  38.78 
 
 		 412 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0054  CinA domain protein  43.66 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  48.89 
 
 		 408 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  48.89 
 
 		 408 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  38.1 
 
 		 412 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  38.1 
 
 		 412 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0259  competence/damage-inducible protein cinA  36.84 
 
 		 424 aa  93.6  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3667  CinA domain-containing protein  42.67 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2949  competence damage-inducible protein A  40.14 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3139  competence damage-inducible protein A  40.14 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000242069 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  38.1 
 
 		 412 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2981  competence damage-inducible protein A  40.14 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355767  decreased coverage  0.0000723064 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  38.1 
 
 		 412 aa  92.8  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0280  competence damage-inducible protein A  42.38 
 
 		 421 aa  92.8  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3614  competence/damage-inducible protein cinA  48.15 
 
 		 408 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1257  hypothetical protein  39.19 
 
 		 419 aa  92.8  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.16075  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0522  competence/damage-inducible protein CinA  38.56 
 
 		 415 aa  92.8  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100645  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3032  competence damage-inducible protein A  40.14 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.162361  hitchhiker  0.00262793 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  38.1 
 
 		 412 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  38.1 
 
 		 412 aa  92  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  38.1 
 
 		 412 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0652  competence/damage-inducible protein CinA  41.45 
 
 		 420 aa  92  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02550  competence damage-inducible protein A  38.16 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0187741  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0989  CinA domain protein  38.16 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00650499  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1012  competence damage-inducible protein A  38.16 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000218203 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2836  competence damage-inducible protein A  38.16 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02515  hypothetical protein  38.16 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2823  competence damage-inducible protein A  38.16 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0804324  hitchhiker  0.00000514203 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2984  competence damage-inducible protein A  38.16 
 
 		 165 aa  92  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0375437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  42.96 
 
 		 413 aa  91.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1022  competence/damage-inducible protein CinA C-terminal domain protein  33.8 
 
 		 243 aa  91.7  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  36.73 
 
 		 412 aa  91.3  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  41.03 
 
 		 203 aa  91.3  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  38.1 
 
 		 412 aa  91.3  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>