280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2406 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2406  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
193 aa  391  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2784  phosphoheptose isomerase  77.72 
 
 
195 aa  292  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  192  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0924  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
193 aa  191  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  189  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  189  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0891  phosphoheptose isomerase  46.99 
 
 
193 aa  189  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  189  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  189  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  189  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  48.09 
 
 
192 aa  189  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0759  phosphoheptose isomerase  46.99 
 
 
192 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  48.09 
 
 
192 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  46.45 
 
 
193 aa  188  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  46.45 
 
 
193 aa  188  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1238  phosphoheptose isomerase  45.36 
 
 
193 aa  188  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  46.45 
 
 
193 aa  188  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1335  phosphoheptose isomerase  48.63 
 
 
191 aa  187  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292937  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0355  phosphoheptose isomerase  48.42 
 
 
191 aa  186  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.902024  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1822  phosphoheptose isomerase  48.24 
 
 
191 aa  184  6e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6781  phosphoheptose isomerase  48.07 
 
 
213 aa  184  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375812  normal  0.778027 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3872  phosphoheptose isomerase  46.24 
 
 
194 aa  182  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  44.81 
 
 
193 aa  181  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03203  phosphoheptose isomerase  47.06 
 
 
191 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5851  phosphoheptose isomerase  43.72 
 
 
190 aa  175  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3443  phosphoheptose isomerase  47.54 
 
 
193 aa  174  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3296  phosphoheptose isomerase  47.54 
 
 
193 aa  174  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  44.74 
 
 
195 aa  174  8e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  46.58 
 
 
189 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2393  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
193 aa  172  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1230  phosphoheptose isomerase  45.36 
 
 
195 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243182  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002778  phosphoheptose isomerase  46.2 
 
 
191 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  44.51 
 
 
189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  50.32 
 
 
192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  49.68 
 
 
192 aa  165  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  45.88 
 
 
222 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  41.11 
 
 
195 aa  164  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  46.24 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  47.24 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  46.11 
 
 
194 aa  159  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  42.64 
 
 
196 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  43.35 
 
 
186 aa  159  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 
197 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 
197 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 
197 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 
197 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 
197 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  45 
 
 
193 aa  157  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 
197 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 
197 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 
197 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  41.58 
 
 
189 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 
197 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  41.62 
 
 
197 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  39.59 
 
 
197 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  41.12 
 
 
197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  41.12 
 
 
195 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  40.1 
 
 
197 aa  154  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  40.61 
 
 
197 aa  154  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  44.58 
 
 
186 aa  154  8e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  44.03 
 
 
186 aa  154  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  41.24 
 
 
198 aa  154  9e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  40.93 
 
 
198 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0578  phosphoheptose isomerase  42.25 
 
 
189 aa  153  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.711121  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  44.23 
 
 
186 aa  153  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
197 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  44.1 
 
 
226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  39.25 
 
 
188 aa  152  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  39.78 
 
 
186 aa  152  4e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  40.79 
 
 
195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  38.69 
 
 
208 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3264  phosphoheptose isomerase  43.31 
 
 
195 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.409403  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  41.67 
 
 
210 aa  150  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  40.11 
 
 
188 aa  150  1e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  36.96 
 
 
214 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  40.21 
 
 
201 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2864  phosphoheptose isomerase  44.17 
 
 
189 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000412375  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  40.21 
 
 
201 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1612  phosphoheptose isomerase  42.18 
 
 
195 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.94358  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  41.24 
 
 
191 aa  148  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1600  phosphoheptose isomerase  40.13 
 
 
194 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4421  phosphoheptose isomerase  40.66 
 
 
195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.440249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4115  phosphoheptose isomerase  39.38 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.726909  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13120  phosphoheptose isomerase  39.18 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  38.86 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57500  phosphoheptose isomerase  38.86 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  40.1 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0354  phosphoheptose isomerase  40.49 
 
 
210 aa  145  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  39.49 
 
 
196 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  41.36 
 
 
195 aa  145  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  42.07 
 
 
196 aa  145  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  44.38 
 
 
198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0909  phosphoheptose isomerase  37.82 
 
 
197 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.247472  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0392  phosphoheptose isomerase  41.08 
 
 
199 aa  144  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.880276  normal  0.0515398 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>