More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1961 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1961  pyruvate kinase  100 
 
 
452 aa  896    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1412  pyruvate kinase  53.35 
 
 
445 aa  479  1e-134  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000231842  hitchhiker  0.00097059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  37.98 
 
 
487 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  37.74 
 
 
471 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  36.71 
 
 
492 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  37.85 
 
 
488 aa  302  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  37.37 
 
 
472 aa  302  8.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  36.5 
 
 
492 aa  300  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  36.75 
 
 
471 aa  299  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  36.46 
 
 
471 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  36.46 
 
 
471 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  36.46 
 
 
471 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  36.73 
 
 
472 aa  295  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  36.99 
 
 
471 aa  293  5e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  37.31 
 
 
478 aa  292  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  36.38 
 
 
477 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2370  pyruvate kinase  36.97 
 
 
518 aa  289  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  36.38 
 
 
477 aa  289  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  35.94 
 
 
483 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  38.74 
 
 
473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  37.1 
 
 
472 aa  286  5e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  36.93 
 
 
473 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  37.45 
 
 
477 aa  286  7e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  37.23 
 
 
477 aa  285  9e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  36.48 
 
 
472 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  35.68 
 
 
476 aa  282  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  35.77 
 
 
484 aa  282  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  36.8 
 
 
474 aa  282  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  40.04 
 
 
480 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  35.5 
 
 
481 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  36.25 
 
 
484 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  36.46 
 
 
477 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  36.25 
 
 
484 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  36 
 
 
497 aa  279  7e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  36.46 
 
 
471 aa  279  7e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  36.25 
 
 
484 aa  279  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  35.87 
 
 
470 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  36.27 
 
 
477 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  35.84 
 
 
477 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  36.25 
 
 
478 aa  277  3e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  37.5 
 
 
581 aa  277  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  36.42 
 
 
476 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  37.39 
 
 
580 aa  276  6e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  35.79 
 
 
478 aa  276  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  35.65 
 
 
478 aa  276  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  38.17 
 
 
584 aa  276  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  37.93 
 
 
470 aa  275  8e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  39.19 
 
 
480 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  35.26 
 
 
479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  38.38 
 
 
474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  35.16 
 
 
476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  37.58 
 
 
479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  36.83 
 
 
470 aa  274  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  35.79 
 
 
585 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  36.11 
 
 
478 aa  273  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  36.9 
 
 
583 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  38.37 
 
 
494 aa  272  8.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  37.82 
 
 
477 aa  272  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  35.59 
 
 
592 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  37.8 
 
 
470 aa  271  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  35.59 
 
 
592 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  36.75 
 
 
476 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  35.73 
 
 
601 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  36.21 
 
 
475 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  37.71 
 
 
477 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  36.11 
 
 
594 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  36.67 
 
 
484 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2866  pyruvate kinase  37.5 
 
 
478 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  36.67 
 
 
474 aa  270  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  35.44 
 
 
482 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2971  pyruvate kinase  38.44 
 
 
478 aa  270  5e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2744  pyruvate kinase  38.44 
 
 
483 aa  270  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  35.53 
 
 
483 aa  269  8.999999999999999e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  36.4 
 
 
586 aa  268  1e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  36.86 
 
 
481 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  37.26 
 
 
472 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0175  pyruvate kinase  35.2 
 
 
477 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281463  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0469  pyruvate kinase  36.93 
 
 
477 aa  267  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  35.65 
 
 
475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  35.84 
 
 
475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  35.48 
 
 
472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  36.13 
 
 
582 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  34.41 
 
 
479 aa  266  5e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0128  pyruvate kinase  37.15 
 
 
478 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.324584 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0582  pyruvate kinase  39.42 
 
 
477 aa  266  5e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  35.55 
 
 
578 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15431  pyruvate kinase  38.89 
 
 
605 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.284197 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  38.03 
 
 
480 aa  266  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  36.25 
 
 
474 aa  266  7e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  36.4 
 
 
496 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  38.57 
 
 
596 aa  265  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  35.27 
 
 
472 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1065  pyruvate kinase  37.69 
 
 
447 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.953714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  37.53 
 
 
480 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  34.45 
 
 
482 aa  265  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4063  pyruvate kinase  39.09 
 
 
488 aa  264  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.910781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  36.05 
 
 
471 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0527  pyruvate kinase  36.74 
 
 
499 aa  265  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  38.1 
 
 
596 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  38.37 
 
 
596 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>