More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1412 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1412  pyruvate kinase  100 
 
 		 445 aa  887    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000231842  hitchhiker  0.00097059 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1961  pyruvate kinase  53.35 
 
 		 452 aa  488  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0202  pyruvate kinase  40.81 
 
 		 484 aa  319  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0263  pyruvate kinase  40.47 
 
 		 484 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3295  pyruvate kinase  38.22 
 
 		 487 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101413  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1638  pyruvate kinase  40.47 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0174  pyruvate kinase  40.47 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.326455  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3452  pyruvate kinase  37.79 
 
 		 488 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.824418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0728  pyruvate kinase  40.38 
 
 		 483 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.201777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4478  pyruvate kinase  39.19 
 
 		 471 aa  305  8.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555634  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0178  pyruvate kinase  38.76 
 
 		 474 aa  301  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1402  pyruvate kinase  40 
 
 		 477 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304037  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  38.57 
 
 		 586 aa  299  6e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3358  pyruvate kinase  38.89 
 
 		 470 aa  299  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  38.27 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1448  pyruvate kinase  37.61 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.438422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3256  pyruvate kinase  38.22 
 
 		 478 aa  298  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.496485  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  40.25 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4301  pyruvate kinase  38.97 
 
 		 471 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3866  pyruvate kinase  38.97 
 
 		 471 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104743  normal  0.747042 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3155  pyruvate kinase  37.87 
 
 		 492 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.561746 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9118  pyruvate kinase  40.76 
 
 		 477 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1568  pyruvate kinase  38.97 
 
 		 471 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1594  pyruvate kinase  37.97 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0190515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1519  pyruvate kinase  38 
 
 		 472 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0210693  decreased coverage  0.0000976418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3590  pyruvate kinase  38.4 
 
 		 479 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768977  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2117  pyruvate kinase  38.63 
 
 		 472 aa  296  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.128445 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4673  pyruvate kinase  39.1 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1423  pyruvate kinase  39.14 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.379623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2676  pyruvate kinase  38.05 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.18741  normal  0.256993 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1999  pyruvate kinase  40.51 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3626  pyruvate kinase  38.97 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.946323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3482  pyruvate kinase  37.45 
 
 		 492 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.587472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1043  pyruvate kinase  39.1 
 
 		 475 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.545814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3982  pyruvate kinase  39.48 
 
 		 475 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2516  pyruvate kinase  38.43 
 
 		 481 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0630  pyruvate kinase  37.37 
 
 		 477 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2858  pyruvate kinase  37.37 
 
 		 477 aa  293  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.810748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3289  pyruvate kinase  37.97 
 
 		 479 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2276  pyruvate kinase  36.58 
 
 		 481 aa  292  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.756319  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  40.47 
 
 		 474 aa  292  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3690  pyruvate kinase  38.27 
 
 		 479 aa  292  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.336343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2308  pyruvate kinase  39.19 
 
 		 473 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.568572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3702  pyruvate kinase  35.9 
 
 		 497 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0596651 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  38.32 
 
 		 585 aa  290  3e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  38.3 
 
 		 482 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1165  pyruvate kinase  37.29 
 
 		 478 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1748  pyruvate kinase  37.71 
 
 		 478 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1688  pyruvate kinase  37.71 
 
 		 478 aa  290  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.525724  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  38.05 
 
 		 581 aa  289  8e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0913  pyruvate kinase  38.09 
 
 		 477 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00173367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  38.25 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3090  pyruvate kinase  38.79 
 
 		 479 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  38.25 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6869  pyruvate kinase  39.74 
 
 		 478 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1864  pyruvate kinase  38.79 
 
 		 470 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.950853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2465  pyruvate kinase  38.09 
 
 		 478 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6782  pyruvate kinase  38.92 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6176  pyruvate kinase  39.22 
 
 		 475 aa  286  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1218  pyruvate kinase  37.55 
 
 		 478 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  38.61 
 
 		 480 aa  285  9e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  37.5 
 
 		 479 aa  285  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0986  pyruvate kinase  37.31 
 
 		 478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.855047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0494  pyruvate kinase  37.87 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.109734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2030  pyruvate kinase  39.01 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3834  pyruvate kinase  36.31 
 
 		 477 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5207  pyruvate kinase  37.79 
 
 		 478 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0792274  normal  0.137713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45050  pyruvate kinase  36.31 
 
 		 477 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0341  pyruvate kinase  37.39 
 
 		 484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0955496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  39.45 
 
 		 478 aa  283  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  39.1 
 
 		 505 aa  283  5.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  36.13 
 
 		 585 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1114  pyruvate kinase  38.19 
 
 		 486 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.679316  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  38.46 
 
 		 496 aa  283  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5962  pyruvate kinase  37.87 
 
 		 478 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  36.56 
 
 		 578 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4660  pyruvate kinase  39.44 
 
 		 470 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1294  pyruvate kinase  38.85 
 
 		 472 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  38.56 
 
 		 471 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  36.13 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  36.13 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  35.92 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0558  pyruvate kinase  37.85 
 
 		 473 aa  281  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  36.13 
 
 		 585 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  39.61 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  36.13 
 
 		 585 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  36.13 
 
 		 585 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  36.13 
 
 		 585 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  36.13 
 
 		 585 aa  280  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  39.79 
 
 		 481 aa  280  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  36.13 
 
 		 585 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  36.13 
 
 		 585 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0716  pyruvate kinase  37.26 
 
 		 466 aa  280  4e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2773  pyruvate kinase  38.33 
 
 		 471 aa  280  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0467936  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  37.45 
 
 		 582 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  38.81 
 
 		 477 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5564  pyruvate kinase  38.72 
 
 		 472 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2486  pyruvate kinase  35.96 
 
 		 481 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1065  pyruvate kinase  36.08 
 
 		 447 aa  277  2e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.953714  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  39.1 
 
 		 471 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>