71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1450 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1450  protein of unknown function DUF87  100 
 
 
581 aa  1170    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0452751  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2164  hypothetical protein  58.67 
 
 
582 aa  703    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000710411 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0358  hypothetical protein  21.45 
 
 
605 aa  73.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1572  hypothetical protein  23.21 
 
 
531 aa  70.5  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.127794  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0983  hypothetical protein  22.39 
 
 
616 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.495624  hitchhiker  0.0000164054 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0395  hypothetical protein  23.5 
 
 
523 aa  66.2  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.190309  normal  0.0716823 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0300  hypothetical protein  21.3 
 
 
611 aa  65.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0577  hypothetical protein  21.58 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0070  protein of unknown function DUF87  23.45 
 
 
500 aa  65.1  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1949  hypothetical protein  23.37 
 
 
591 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198578  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1821  hypothetical protein  20.93 
 
 
608 aa  60.5  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1112  hypothetical protein  21.57 
 
 
524 aa  58.9  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2030  hypothetical protein  23.16 
 
 
589 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309935 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1243  hypothetical protein  32.35 
 
 
510 aa  56.2  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0970  hypothetical protein  25 
 
 
557 aa  56.2  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16755  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1361  hypothetical protein  22.07 
 
 
523 aa  55.1  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.26972  normal  0.0191854 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0047  hypothetical protein  28.57 
 
 
486 aa  53.5  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1723  hypothetical protein  21.48 
 
 
524 aa  53.5  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1416  protein of unknown function DUF87  20.63 
 
 
617 aa  53.5  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4448  hypothetical protein  27.69 
 
 
587 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278839 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1732  hypothetical protein  20.47 
 
 
524 aa  52.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000995714 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1482  hypothetical protein  21.89 
 
 
546 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3208  hypothetical protein  31.06 
 
 
579 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.454829  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  23.62 
 
 
508 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1259  protein of unknown function DUF87  23.94 
 
 
540 aa  51.6  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0931  domain of unknown function protein  21.43 
 
 
607 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0941  AAA ATPase  25.71 
 
 
456 aa  50.8  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0685894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1344  hypothetical protein  26.43 
 
 
451 aa  50.4  0.00008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1870  protein of unknown function DUF87  21.43 
 
 
559 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.853161  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  31.46 
 
 
496 aa  49.3  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3348  hypothetical protein  21.95 
 
 
628 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989133  normal  0.0467064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0443  protein of unknown function DUF87  26.32 
 
 
360 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0177789  normal  0.220913 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0816  hypothetical protein  25.71 
 
 
452 aa  49.7  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.723695  normal  0.916322 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1624  protein of unknown function DUF87  25.17 
 
 
557 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1070  hypothetical protein  26.67 
 
 
452 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3687  hypothetical protein  24.12 
 
 
594 aa  48.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0286808  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2356  hypothetical protein  37.25 
 
 
603 aa  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2094  hypothetical protein  21.95 
 
 
582 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1877  protein of unknown function DUF87  28.29 
 
 
560 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0326  hypothetical protein  23.87 
 
 
497 aa  47.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.519227  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1394  hypothetical protein  20.18 
 
 
559 aa  47.4  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1871  hypothetical protein  23.92 
 
 
550 aa  47.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1508  hypothetical protein  20.05 
 
 
584 aa  47.4  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.496743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2157  AAA ATPase  27.62 
 
 
504 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.969754  normal  0.641302 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0135  protein of unknown function DUF87  34.69 
 
 
520 aa  47.4  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0231678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3715  hypothetical protein  25.16 
 
 
601 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1948  AAA ATPase  26.67 
 
 
503 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315114  normal  0.618024 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0252  ATPase-like protein  31.07 
 
 
537 aa  46.2  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0650  ATPase protein  24.17 
 
 
709 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2465  protein of unknown function DUF87  23.45 
 
 
600 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2238  protein of unknown function DUF87  21.81 
 
 
583 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2116  hypothetical protein  19.85 
 
 
583 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0461  ATPase  25.74 
 
 
492 aa  46.2  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3486  ATPase-like protein  25 
 
 
574 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.123894  normal  0.207133 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3657  ATPase-like protein  26.52 
 
 
490 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.16812  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1687  hypothetical protein  28.33 
 
 
546 aa  45.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1408  hypothetical protein  24.52 
 
 
497 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.502855  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6263  hypothetical protein  28.3 
 
 
504 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311693 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6246  AAA ATPase  33.33 
 
 
520 aa  44.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7061  AAA ATPase  33.33 
 
 
500 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0332905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1920  hypothetical protein  25.71 
 
 
526 aa  44.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0511  hypothetical protein  24.52 
 
 
497 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4482  ATPase  29.13 
 
 
502 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.197027 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4054  protein of unknown function DUF87  26.09 
 
 
709 aa  43.9  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0459328  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  26.52 
 
 
504 aa  43.9  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2699  AAA ATPase  22.04 
 
 
603 aa  43.9  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.480316  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2035  ATPase  28.3 
 
 
506 aa  43.9  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3642  ATPase-like  24.2 
 
 
558 aa  43.9  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.361749  normal  0.410506 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1296  hypothetical protein  32.47 
 
 
599 aa  43.9  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3413  ATPase  28.3 
 
 
516 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4476  protein of unknown function DUF87  22.22 
 
 
593 aa  43.5  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192714 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>