48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3749 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1176    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  32.6 
 
 		 564 aa  240  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  30.99 
 
 		 401 aa  91.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  30.04 
 
 		 694 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  29.55 
 
 		 741 aa  79.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  28.7 
 
 		 631 aa  70.5  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  27.73 
 
 		 677 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.47 
 
 		 721 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.58 
 
 		 724 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  28.5 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.83 
 
 		 720 aa  56.2  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  27.71 
 
 		 487 aa  55.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  27.11 
 
 		 488 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  25.6 
 
 		 369 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  28 
 
 		 494 aa  50.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  28 
 
 		 493 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  27.08 
 
 		 494 aa  50.4  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  28 
 
 		 493 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  28 
 
 		 493 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  27.97 
 
 		 356 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  28 
 
 		 494 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  28 
 
 		 494 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 		 632 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  26.49 
 
 		 500 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5776  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  23.92 
 
 		 507 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  23.74 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  24.85 
 
 		 503 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  27.06 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  25.13 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  27.06 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  27.06 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  27.06 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  27.06 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  27.06 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  27.06 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  25.44 
 
 		 504 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  27.06 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  22.08 
 
 		 363 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2063  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.87 
 
 		 308 aa  45.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239523  hitchhiker  0.000119694 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0325  hypothetical protein  28.49 
 
 		 491 aa  44.7  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  24.35 
 
 		 503 aa  45.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 512 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.05 
 
 		 254 aa  44.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1898  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.05 
 
 		 254 aa  44.7  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  31.76 
 
 		 363 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  29.21 
 
 		 471 aa  44.3  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.94 
 
 		 565 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>