More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0308 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  64.49 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  63.55 
 
 		 107 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  63.55 
 
 		 107 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  62.62 
 
 		 107 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  62.86 
 
 		 108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  62.62 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  59.05 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  61.68 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  61.68 
 
 		 107 aa  134  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  57.14 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  51.46 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  47.06 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  46.07 
 
 		 116 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  42.86 
 
 		 116 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  38.46 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  43.33 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  41.11 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  41.57 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  37.86 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  36.46 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  39.33 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  37.36 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  37.36 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  37.62 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  41.38 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  37.08 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  36.26 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  36.17 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  42.42 
 
 		 280 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 		 459 aa  62  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  41.77 
 
 		 145 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 459 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 459 aa  62  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  42.86 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  35.63 
 
 		 459 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  31.96 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  35.63 
 
 		 459 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  35.63 
 
 		 459 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0263  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2500  rhodanese-like protein  45.45 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44 
 
 		 837 aa  60.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3083  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  49.12 
 
 		 182 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.200312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0930  hypothetical protein  39.24 
 
 		 97 aa  60.5  0.000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0119442  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  40.28 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  31 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2405  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.88 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.692685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  38.89 
 
 		 117 aa  60.1  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  33.72 
 
 		 565 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  41.98 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  46.27 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  38.27 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  46.27 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  43.42 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1523  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.16 
 
 		 550 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.861068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  44.78 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  40 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.88 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0484  rhodanese-related sulfurtransferase  40.91 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  32.99 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  31.25 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  38.27 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1537  rhodanese-related sulfurtransferase  36.76 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  35.53 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  40.3 
 
 		 216 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  42.42 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  43.28 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1212  rhodanese domain-containing protein  41.79 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  0.0818549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  34.09 
 
 		 471 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.74 
 
 		 834 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  39.06 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1605  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  41.79 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  39.06 
 
 		 471 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  39.19 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0016  GlpE protein  31.76 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1508  Rhodanese domain protein  37.66 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  51.16 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  34.38 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0869  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  40.3 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  36.9 
 
 		 116 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>