More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9272 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9272  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  100 
 
 		 647 aa  1222    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  52.78 
 
 		 807 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  43.65 
 
 		 575 aa  362  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.83 
 
 		 513 aa  128  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 430 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  29.49 
 
 		 519 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  29.23 
 
 		 519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.83 
 
 		 528 aa  113  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.48 
 
 		 481 aa  111  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 501 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 500 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 500 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.48 
 
 		 481 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 525 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  29.38 
 
 		 532 aa  109  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  28.65 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  30.7 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 512 aa  108  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.2 
 
 		 481 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2891  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.38 
 
 		 477 aa  108  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  29.49 
 
 		 547 aa  108  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.77 
 
 		 482 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 500 aa  107  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  29.86 
 
 		 539 aa  107  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.69 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 1043 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 515 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.48 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4061  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 499 aa  106  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  30.09 
 
 		 530 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.2 
 
 		 482 aa  105  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.2 
 
 		 482 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.69 
 
 		 482 aa  104  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  28.53 
 
 		 511 aa  104  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  29.21 
 
 		 536 aa  104  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.36 
 
 		 554 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 520 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  29.72 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.91 
 
 		 481 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 537 aa  103  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.91 
 
 		 482 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  28.21 
 
 		 576 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.19 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.95 
 
 		 498 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2435  O-succinylbenzoate-CoA ligase  26.87 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.900317  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  29.72 
 
 		 510 aa  102  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 525 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 501 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.98 
 
 		 543 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  29.61 
 
 		 504 aa  101  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0401  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 		 535 aa  101  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 487 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 503 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4129  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 		 497 aa  100  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.706043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.75 
 
 		 570 aa  100  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 498 aa  100  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  30.59 
 
 		 503 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  30.46 
 
 		 507 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  29.91 
 
 		 510 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.62 
 
 		 503 aa  99.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  29.15 
 
 		 509 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 508 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.21 
 
 		 579 aa  99  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1102  non-ribosomal peptide synthetase  30.42 
 
 		 1345 aa  99  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0166801  normal  0.534477 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4133  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 497 aa  99  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  29.04 
 
 		 506 aa  99.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  30.11 
 
 		 511 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 499 aa  98.6  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 513 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  28.88 
 
 		 543 aa  98.6  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 510 aa  98.2  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4219  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.34 
 
 		 491 aa  98.2  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.121755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0023  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.9 
 
 		 494 aa  98.6  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692894  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.67 
 
 		 481 aa  97.8  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 526 aa  98.2  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  28.23 
 
 		 517 aa  97.8  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  27.93 
 
 		 565 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.62 
 
 		 490 aa  97.4  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 521 aa  97.4  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 505 aa  97.4  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 521 aa  97.4  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1920  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.36 
 
 		 510 aa  97.4  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  28.41 
 
 		 504 aa  97.4  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 		 565 aa  97.4  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 		 508 aa  97.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 		 517 aa  97.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 		 495 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  29.4 
 
 		 507 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.05 
 
 		 556 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 530 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8226  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 515 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.198543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.35 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.05 
 
 		 556 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  28.13 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  29.83 
 
 		 508 aa  96.3  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2549  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 		 550 aa  95.9  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.798559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>