36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7688 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7688  putative beta-lactamase  100 
 
 		 458 aa  920    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3317  beta-lactamase class A-like protein  41.18 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313271  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03960  hypothetical protein  34.92 
 
 		 453 aa  186  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0388079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1090  putative beta-lactamase  32.98 
 
 		 443 aa  162  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1000  putative beta-lactamase  35.71 
 
 		 390 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1646  beta lactamase-related protein, putative  35.71 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33460  hypothetical protein  33.43 
 
 		 424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1434  beta-lactamase  28.67 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.685838 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4838  putative lipoprotein LpqF  30.65 
 
 		 443 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4752  putative lipoprotein LpqF  30.65 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5138  putative lipoprotein LpqF  27.23 
 
 		 443 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5353  beta-lactamase  27.85 
 
 		 454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13626  lipoprotein lpqF  30.36 
 
 		 452 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7641599999999997e-27  normal  0.0255048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0173  hypothetical protein  53.06 
 
 		 130 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0715  beta-lactamase family protein  34.95 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1950  beta-lactamase family protein  35.05 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08971  putative beta-lactamase  37.08 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.712716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1443  beta-lactamase  33.9 
 
 		 283 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69594  normal  0.126584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1634  beta-lactamase  34.78 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1608  beta-lactamase  33.7 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1603  beta-lactamase  32.29 
 
 		 375 aa  50.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.955317  normal  0.378927 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11351  Beta-lactamase class A  26.4 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.470021  normal  0.82694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4774  beta-lactamase  34.74 
 
 		 442 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167145 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0182  beta-lactamase  33.96 
 
 		 327 aa  48.5  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.689531 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3972  beta-lactamase  32.94 
 
 		 305 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0506092  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1408  penicillin-binding protein, transpeptidase  30 
 
 		 504 aa  47  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4223  beta-lactamase  31.11 
 
 		 508 aa  46.6  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0316  beta-lactamase  28.91 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00360568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5713  beta-lactamase  31.91 
 
 		 292 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3876  beta-lactamase  34.21 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0589748 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4436  beta-lactamase class A-like protein  27.66 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0101027  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1291  beta-lactamase, putative  38.2 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0046  beta-lactamase TEM  25.5 
 
 		 286 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00171312  normal  0.356541 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1580  beta-lactamase TEM  25.5 
 
 		 286 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0130  beta-lactamase TEM  25.5 
 
 		 286 aa  43.5  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1147  putative beta-lactamase  30.77 
 
 		 423 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>