More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6107 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
172 aa  337  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  68.32 
 
 
168 aa  222  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  67.43 
 
 
175 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  59.77 
 
 
176 aa  201  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  61.18 
 
 
184 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  61.49 
 
 
177 aa  187  8e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  50.62 
 
 
170 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
172 aa  181  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  53.61 
 
 
172 aa  178  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  56.21 
 
 
178 aa  176  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  58.93 
 
 
185 aa  176  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
187 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 
174 aa  176  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  59.06 
 
 
187 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 
177 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 
187 aa  176  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  50.88 
 
 
172 aa  175  3e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 
187 aa  174  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  49.7 
 
 
173 aa  174  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2358  adenine phosphoribosyltransferase  62.96 
 
 
187 aa  173  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1952  adenine phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  55.88 
 
 
188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  48.59 
 
 
182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  60.12 
 
 
185 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  48.3 
 
 
180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
176 aa  171  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  53.94 
 
 
214 aa  171  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 
170 aa  171  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2619  adenine phosphoribosyltransferase  50.62 
 
 
173 aa  171  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  48.3 
 
 
180 aa  171  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  49.08 
 
 
171 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  50.91 
 
 
181 aa  170  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 
175 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0751  adenine phosphoribosyltransferase  57.67 
 
 
172 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.48734  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
185 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 
170 aa  169  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
172 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
171 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
181 aa  168  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0816  adenine phosphoribosyltransferase  53.66 
 
 
171 aa  168  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
181 aa  168  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
181 aa  168  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
171 aa  167  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0798  adenine phosphoribosyltransferase  57.67 
 
 
172 aa  167  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0128483  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  47.95 
 
 
179 aa  167  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  57.52 
 
 
177 aa  167  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 
179 aa  167  6e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0802  adenine phosphoribosyltransferase  57.67 
 
 
172 aa  167  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0377  adenine phosphoribosyltransferase  48.28 
 
 
176 aa  167  6e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
181 aa  167  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
171 aa  166  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  55.29 
 
 
188 aa  166  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0781  adenine phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 
172 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 
172 aa  166  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  50.61 
 
 
172 aa  166  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  51.18 
 
 
185 aa  166  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  50.9 
 
 
181 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
172 aa  165  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0299  adenine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
202 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2098  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
198 aa  165  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  49.72 
 
 
184 aa  165  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  47.34 
 
 
181 aa  164  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0272  adenine phosphoribosyltransferase  51.2 
 
 
202 aa  164  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
178 aa  164  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1558  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
171 aa  164  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.459333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  48.02 
 
 
182 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1375  adenine phosphoribosyltransferase  57.06 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.801683  normal  0.0681221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2682  adenine phosphoribosyltransferase  48.85 
 
 
171 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  164  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4379  adenine phosphoribosyltransferase  51.23 
 
 
172 aa  163  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0485  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.994648  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  50.3 
 
 
184 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  48.55 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  52.76 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  47.67 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  52.15 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  49.4 
 
 
190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  53.05 
 
 
170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  50.62 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  48.55 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0547  adenine phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
174 aa  161  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1345  adenine phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 
171 aa  162  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000290871  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0625  adenine phosphoribosyltransferase  46.51 
 
 
178 aa  162  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  48.5 
 
 
181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  50.92 
 
 
179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  51.12 
 
 
177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  48.47 
 
 
197 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13598  Adenine phosphoribosyl transferase  50 
 
 
173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910884  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  50.66 
 
 
424 aa  160  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>