278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3812 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3812  phosphoheptose isomerase  100 
 
 
225 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0616302  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08080  phosphoheptose isomerase  61.32 
 
 
224 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4583  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  61.14 
 
 
221 aa  217  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3233  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  52.13 
 
 
223 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2617  phosphoheptose isomerase  53.24 
 
 
218 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.529886 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0862  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296003  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0714  phosphoheptose isomerase  42.86 
 
 
231 aa  165  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3209  phosphoheptose isomerase  45.59 
 
 
228 aa  164  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0473  phosphoheptose isomerase  44.17 
 
 
199 aa  151  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2549  Phosphoheptose isomerase-like protein  43.41 
 
 
391 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0968114  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  42.78 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  43.32 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  42.78 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08100  phosphoheptose isomerase  47.13 
 
 
206 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  41.34 
 
 
197 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  44.69 
 
 
210 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  40.91 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  39.02 
 
 
197 aa  126  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  40.11 
 
 
214 aa  125  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  41.03 
 
 
197 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  41.03 
 
 
197 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  43.48 
 
 
189 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  43.36 
 
 
195 aa  124  1e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  41.03 
 
 
192 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  41.03 
 
 
192 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  41.03 
 
 
192 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  41.03 
 
 
192 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  41.03 
 
 
192 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4581  phosphoheptose isomerase  41.86 
 
 
203 aa  121  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  45.34 
 
 
199 aa  121  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2337  phosphoheptose isomerase  39.57 
 
 
214 aa  121  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  42.17 
 
 
186 aa  121  8e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  44 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  41.67 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  40.61 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  40.98 
 
 
226 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0256  phosphoheptose isomerase  38.8 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.245661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1897  phosphoheptose isomerase  44.52 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.638192  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0506  phosphoheptose isomerase  39.76 
 
 
185 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0770  phosphoheptose isomerase  39.13 
 
 
187 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  38.76 
 
 
197 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2656  DnaA initiator-associating protein DiaA  35.68 
 
 
196 aa  119  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.967641  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  36.94 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  41.77 
 
 
189 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2370  phosphoheptose isomerase  41.94 
 
 
196 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000861187  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2319  phosphoheptose isomerase  41.94 
 
 
196 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3790  phosphoheptose isomerase  40.96 
 
 
200 aa  118  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0031  phosphoheptose isomerase  40.13 
 
 
200 aa  118  9e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000157257  hitchhiker  0.0000000939635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  36.93 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  37.08 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  36.26 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1990  phosphoheptose isomerase  38.05 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  37.08 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  37.08 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  37.08 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  36.93 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  38.42 
 
 
196 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  37.08 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  37.08 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0686  phosphoheptose isomerase  42.55 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.111927  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  37.08 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  37.08 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  37.08 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  37.29 
 
 
186 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  37.06 
 
 
186 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  35.67 
 
 
201 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3114  phosphoheptose isomerase  36.97 
 
 
191 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  37.5 
 
 
197 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  40.12 
 
 
672 aa  116  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  35.67 
 
 
201 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  40.76 
 
 
210 aa  115  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0111  phosphoheptose isomerase  34.76 
 
 
196 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  36.55 
 
 
198 aa  115  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  35.96 
 
 
197 aa  115  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3810  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  39.26 
 
 
214 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  36.52 
 
 
196 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004503  phosphoheptose isomerase  34.22 
 
 
196 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1118  phosphoheptose isomerase  34.64 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  41.83 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  38.07 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0387  phosphoheptose isomerase  35.96 
 
 
197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.889842  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00889  hypothetical protein  34.22 
 
 
196 aa  112  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  35.06 
 
 
186 aa  113  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  43.45 
 
 
358 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  43.45 
 
 
358 aa  112  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0035  phosphoheptose isomerase  38.18 
 
 
210 aa  112  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0672429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  40 
 
 
193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  39.67 
 
 
195 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  42 
 
 
195 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  36 
 
 
208 aa  111  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1812  phosphoheptose isomerase  40.82 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  40.35 
 
 
650 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  39.1 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  39.49 
 
 
188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0321  phosphoheptose isomerase  39.16 
 
 
199 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0688781  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  39.74 
 
 
192 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  40 
 
 
195 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  36.27 
 
 
204 aa  109  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  37.22 
 
 
197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4510  phosphoheptose isomerase  37.97 
 
 
195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>