More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0598 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  100 
 
 		 331 aa  651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0295  trans-hexaprenyltranstransferase  76.06 
 
 		 331 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  62.85 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  65.59 
 
 		 349 aa  390  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4404  Trans-hexaprenyltranstransferase  65.14 
 
 		 331 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  59.75 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  62.27 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  61.22 
 
 		 352 aa  357  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  61.54 
 
 		 356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4449  polyprenyl synthetase  60.86 
 
 		 344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0447682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  59.88 
 
 		 338 aa  346  3e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  55.52 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  57.72 
 
 		 334 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  54.18 
 
 		 351 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1102  Trans-hexaprenyltranstransferase  52.55 
 
 		 338 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  55.59 
 
 		 333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  54.97 
 
 		 322 aa  320  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  51.22 
 
 		 335 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  51.38 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  51.22 
 
 		 342 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5253  trans-hexaprenyltranstransferase  50.76 
 
 		 335 aa  305  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  50.76 
 
 		 337 aa  305  8.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0992  trans-hexaprenyltranstransferase  51.22 
 
 		 329 aa  299  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0988  Polyprenyl synthetase  53.4 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0649  Polyprenyl synthetase  51.36 
 
 		 344 aa  289  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.790786  normal  0.0239993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  48.78 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10572  polyprenyl-diphosphate synthase grcC1  51.31 
 
 		 335 aa  279  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.441257 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  49.24 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21410  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  50.51 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.242583  hitchhiker  0.0000164953 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.62 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  48.17 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0733  Trans-hexaprenyltranstransferase  49.68 
 
 		 326 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2825  Polyprenyl synthetase  48.15 
 
 		 366 aa  266  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0348923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  46.89 
 
 		 367 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.08 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  44.78 
 
 		 343 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11007  polyprenyl-diphosphate synthase grcC2  40.51 
 
 		 325 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000025551  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  35.62 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  37.58 
 
 		 318 aa  186  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.33 
 
 		 323 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  33.44 
 
 		 320 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  37.15 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.39 
 
 		 320 aa  178  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  36.84 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  35.65 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  36.84 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.76 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  34.04 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  37.19 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  36.31 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.81 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  35.11 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  34.6 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.65 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  32.91 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.65 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.65 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.65 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.49 
 
 		 320 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.49 
 
 		 320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.65 
 
 		 320 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.33 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.33 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  33.86 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  32.28 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  29.17 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  33.33 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  34.06 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  31.75 
 
 		 313 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1905  Polyprenyl synthetase  42.74 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  32.22 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  30.84 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  33.79 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.32 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  29.84 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  33.45 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  36.56 
 
 		 334 aa  156  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.88 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  31.49 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  31.5 
 
 		 323 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  31.5 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  31.5 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  31.5 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  31.5 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  31.5 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  34.15 
 
 		 335 aa  155  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  31.5 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  34.81 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  31.5 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  33.1 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.69 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  31.5 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0742  trans-hexaprenyltranstransferase  32.37 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.247757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  27.56 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0657  polyprenyl synthetase  32.37 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  30.99 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  30.7 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  30.7 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  31.37 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  31.37 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>