200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4375 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4375  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  100 
 
 		 372 aa  763    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.417275 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3153  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  74.18 
 
 		 373 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4847  hypothetical protein  75.07 
 
 		 372 aa  557  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.601246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4728  hypothetical protein  74.12 
 
 		 372 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4792  hypothetical protein  74.53 
 
 		 372 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0430  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  74.12 
 
 		 372 aa  553  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4697  hypothetical protein  74.26 
 
 		 372 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.547246 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4826  hypothetical protein  74.26 
 
 		 372 aa  551  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0918  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  74.38 
 
 		 372 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0105  hypothetical protein  70.4 
 
 		 348 aa  497  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5002  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  51 
 
 		 367 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4959  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  48.63 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4579  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  48.63 
 
 		 367 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4739  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  48.63 
 
 		 367 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5099  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  48.63 
 
 		 367 aa  336  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4987  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  48.35 
 
 		 367 aa  335  7e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4598  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase; selenocysteine synthase  48.63 
 
 		 367 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4974  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  47.8 
 
 		 367 aa  331  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4688  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  49.57 
 
 		 367 aa  329  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0261  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  47.53 
 
 		 367 aa  328  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.262008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0676  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  42.9 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3866  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  42.9 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.559786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3272  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  42.78 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3975  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  42.47 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.133901  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3993  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  42.47 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4047  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  42.47 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0548491 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4098  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  41.92 
 
 		 369 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4161  putative pyridoxal phosphate-dependent enzyme  41.76 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  0.579159 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5759  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  36.95 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.646746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6666  L-seryl-tRNA selenium transferase  36.44 
 
 		 398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184749  normal  0.0169225 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2704  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.32 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2990  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  36 
 
 		 398 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.625674  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5094  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase  35.53 
 
 		 398 aa  176  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0940  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  31.38 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0175  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  30.97 
 
 		 411 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6463  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  27.89 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3968  L-seryl-tRNA(ser) selenium transferase protein  27.33 
 
 		 406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.456181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0099  L-seryl-tRNA selenium transferase  27.49 
 
 		 406 aa  123  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.789274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3964  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  26.38 
 
 		 407 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.741974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1144  pyridoxal phosphate-dependent enzyme, putative  27.32 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.46182  normal  0.521262 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2440  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  24.05 
 
 		 406 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0244624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0481  selenocysteine synthase (seryl-tRNASer selenium transferase)-like protein  26.85 
 
 		 511 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.11487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1021  Pyridoxal phosphate-dependent transferase  27.11 
 
 		 407 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0672  selenocysteine synthase  24.61 
 
 		 462 aa  77.4  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1646  selenocysteine synthase  25.62 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000318162  unclonable  0.000000000338513 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2085  selenocysteine synthase  22.89 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3486  selenocysteine synthase  26.96 
 
 		 484 aa  69.7  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0801308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4522  selenocysteine synthase  26.73 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2392  selenocysteine synthase  27.18 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.36039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2373  selenocysteine synthase  22.08 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1678.1  selenocysteine synthase  26.7 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1814  selenocysteine synthase  28.23 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.071718 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0726  selenocysteine synthase  26.7 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0711  selenocysteine synthase  27.32 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3381  selenocysteine synthase  28.64 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1696  selenocysteine synthase  26.7 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1903  selenocysteine synthase  26.7 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2255  selenocysteine synthase  26.7 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0575  selenocysteine synthase  26.7 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.81182  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2706  selenocysteine synthase  23.69 
 
 		 468 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3883  selenocysteine synthase  28.64 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1093  selenocysteine synthase  24.01 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4157  selenocysteine synthase  25.61 
 
 		 478 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.109282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2965  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  28.57 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158372  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3988  selenocysteine synthase  23.57 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3540  selenocysteine synthase  23.57 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2186  selenocysteine synthase  22.94 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000130274  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0760  selenocysteine synthase  25.9 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.306605  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0819  selenocysteine synthase  27.75 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0548  selenocysteine synthase  22.3 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.147839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0527  selenocysteine synthase  23.02 
 
 		 475 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0488  L-seryl-tRNA selenium transferase  26.81 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.117557  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0493  selenocysteine synthase  23.02 
 
 		 475 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0301  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  24.6 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2561  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  27.45 
 
 		 470 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0482  selenocysteine synthase  23.56 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.112411  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0873  selenocysteine synthase  27.5 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4593  selenocysteine synthase  27.32 
 
 		 500 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.263518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3059  selenocysteine synthase  24.3 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00615002  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6556  selenocysteine synthase  22.81 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0759041  decreased coverage  0.00101657 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0831  selenocysteine synthase  24.32 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.322314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63540  selenocysteine synthase  24.5 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4267  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  24.84 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000207221  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2096  selenocysteine synthase  25.68 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.247494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1740  selenocysteine synthase  27.06 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.820555  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5527  selenocysteine synthase  24.5 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0104  selenocysteine synthase  26.96 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0109  selenocysteine synthase  26.96 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0108  selenocysteine synthase  26.96 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0101  selenocysteine synthase  28.08 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1380  selenocysteine synthase  24.66 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.924415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1162  L-seryl-tRNA(Sec) selenium transferase  22.14 
 
 		 476 aa  59.7  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0106  selenocysteine synthase  28.08 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0536  selenocysteine synthase  22.91 
 
 		 475 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0105  selenocysteine synthase  28.08 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0106  selenocysteine synthase  28.08 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0140  selenocysteine synthase  27.07 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4162  selenocysteine synthase  24.63 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1569  selenocysteine synthase  24.66 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.339371  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2549  selenocysteine synthase  23.76 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>