217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3829 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3829  lysophospholipid transporter LplT  100 
 
 
398 aa  780    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0976  lysophospholipid transporter LplT  82.16 
 
 
406 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3245  lysophospholipid transporter LplT  82.16 
 
 
406 aa  608  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0158938  hitchhiker  0.00481427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1028  lysophospholipid transporter LplT  82.16 
 
 
406 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0751  lysophospholipid transporter LplT  75.51 
 
 
415 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02683  predicted inner membrane protein  77.27 
 
 
397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.018578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0855  major facilitator superfamily MFS_1  77.27 
 
 
397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.191502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0880  lysophospholipid transporter LplT  77.53 
 
 
397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16932  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3027  lysophospholipid transporter LplT  77.53 
 
 
397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4102  lysophospholipid transporter LplT  77.53 
 
 
397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120469  hitchhiker  0.000572662 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2982  lysophospholipid transporter LplT  77.78 
 
 
397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0020769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2983  lysophospholipid transporter LplT  77.78 
 
 
397 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0384881  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02644  hypothetical protein  77.27 
 
 
397 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0181673  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3155  lysophospholipid transporter LplT  79.17 
 
 
387 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00836608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3462  lysophospholipid transporter LplT  74.88 
 
 
407 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3616  lysophospholipid transporter LplT  75.37 
 
 
407 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3222  lysophospholipid transporter LplT  78.54 
 
 
400 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3156  lysophospholipid transporter LplT  78.54 
 
 
400 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.138727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3337  lysophospholipid transporter LplT  78.54 
 
 
400 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3237  lysophospholipid transporter LplT  78.54 
 
 
400 aa  564  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000025684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3174  lysophospholipid transporter LplT  78.28 
 
 
400 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3276  lysophospholipid transporter LplT  77.27 
 
 
397 aa  560  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.120069  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0767  lysophospholipid transporter LplT  73.08 
 
 
404 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2630  lysophospholipid transporter LplT  55.2 
 
 
403 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1811  major facilitator superfamily MFS_1  51.04 
 
 
406 aa  355  1e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2310  lysophospholipid transporter LplT  45.04 
 
 
389 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1718  lysophospholipid transporter LplT  43.81 
 
 
405 aa  296  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.964759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2116  lysophospholipid transporter LplT  42.68 
 
 
424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0816109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2254  lysophospholipid transporter LplT  39.39 
 
 
416 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0274694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1576  lysophospholipid transporter LplT  39.14 
 
 
435 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3233  lysophospholipid transporter LplT  39.14 
 
 
435 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2459  lysophospholipid transporter LplT  39.14 
 
 
435 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2006  lysophospholipid transporter LplT  38.9 
 
 
435 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2079  lysophospholipid transporter LplT  39.14 
 
 
451 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2515  lysophospholipid transporter LplT  39.14 
 
 
451 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1351  lysophospholipid transporter LplT  39.14 
 
 
451 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0425999  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0918  lysophospholipid transporter LplT  39.62 
 
 
439 aa  257  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2478  lysophospholipid transporter LplT  38.39 
 
 
435 aa  256  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00685032  hitchhiker  0.000365442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1659  lysophospholipid transporter LplT  38.39 
 
 
435 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3825  lysophospholipid transporter LplT  41.93 
 
 
419 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339646  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1237  lysophospholipid transporter LplT  38.15 
 
 
435 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111638  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1984  lysophospholipid transporter LplT  42.04 
 
 
421 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.943557  normal  0.503134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1360  lysophospholipid transporter LplT  39.57 
 
 
435 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400327  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5349  lysophospholipid transporter LplT  37.91 
 
 
435 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2465  lysophospholipid transporter LplT  44.83 
 
 
403 aa  248  9e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2059  lysophospholipid transporter LplT  37.91 
 
 
435 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690395  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6037  lysophospholipid transporter LplT  37.91 
 
 
435 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00485648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2072  lysophospholipid transporter LplT  37.91 
 
 
435 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2040  lysophospholipid transporter LplT  37.91 
 
 
435 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1941  lysophospholipid transporter LplT  37.91 
 
 
435 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23021  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0487  lysophospholipid transporter LplT  37.62 
 
 
427 aa  243  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0924  lysophospholipid transporter LplT  38.17 
 
 
439 aa  240  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358434  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1935  lysophospholipid transporter LplT  38.85 
 
 
439 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1399  lysophospholipid transporter LplT  39.1 
 
 
439 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344137  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1370  lysophospholipid transporter LplT  39.62 
 
 
438 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495863  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0192  lysophospholipid transporter LplT  38.08 
 
 
426 aa  229  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0175  lysophospholipid transporter LplT  38.12 
 
 
425 aa  228  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0193  lysophospholipid transporter LplT  38.12 
 
 
425 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0921  lysophospholipid transporter LplT  36.87 
 
 
417 aa  226  8e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0252  lysophospholipid transporter LplT  37.87 
 
 
426 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.697841  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1309  lysophospholipid transporter LplT  38.92 
 
 
459 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00718572  normal  0.641684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1243  lysophospholipid transporter LplT  38.68 
 
 
438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.621114  normal  0.61438 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1398  lysophospholipid transporter LplT  37.77 
 
 
432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295071 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4338  lysophospholipid transporter LplT  38.35 
 
 
434 aa  222  8e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497133  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0130  lysophospholipid transporter LplT  37.99 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1618  lysophospholipid transporter LplT  38 
 
 
432 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2519  lysophospholipid transporter LplT  37.77 
 
 
432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177728  hitchhiker  0.00000217459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0228  lysophospholipid transporter LplT  37.38 
 
 
434 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3563  lysophospholipid transporter LplT  37.13 
 
 
425 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738442  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0310  lysophospholipid transporter LplT  37.38 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571757  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3608  lysophospholipid transporter LplT  37.62 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1454  lysophospholipid transporter LplT  38.6 
 
 
422 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812934  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  28.57 
 
 
626 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.95 
 
 
632 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.58 
 
 
635 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.14 
 
 
635 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.34 
 
 
645 aa  89.4  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.09 
 
 
626 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1136  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.55 
 
 
634 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492362  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  29.46 
 
 
1128 aa  87  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  26.8 
 
 
644 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  26.39 
 
 
644 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0537  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.81 
 
 
654 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0160332 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  26.39 
 
 
604 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  26.39 
 
 
604 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  26.39 
 
 
644 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  26.39 
 
 
644 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.11 
 
 
644 aa  84.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0248879  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1690  major facilitator transporter  27.01 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.86317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5079  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.12 
 
 
652 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0339  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.61 
 
 
888 aa  82.8  0.000000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  26.02 
 
 
635 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.64 
 
 
645 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4497  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.34 
 
 
644 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.170703 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.92 
 
 
644 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.92 
 
 
644 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.92 
 
 
644 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  25.91 
 
 
645 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0309  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.58 
 
 
658 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  25.92 
 
 
644 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>