More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1415 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
546 aa  1105    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2982  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 
541 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2457  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 
555 aa  368  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.890786  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.98 
 
 
561 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.769355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 
562 aa  368  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3517  methyl-accepting chemotaxis protein  45.45 
 
 
536 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.549342 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1643  methyl-accepting chemotaxis protein  45.45 
 
 
536 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  43.13 
 
 
533 aa  360  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 
561 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.8 
 
 
566 aa  356  5e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  42.37 
 
 
533 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  42.37 
 
 
533 aa  354  2e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1981  methyl-accepting protein IV  42.51 
 
 
533 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.51 
 
 
533 aa  352  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  42.51 
 
 
533 aa  352  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2118  methyl-accepting protein IV  42.18 
 
 
533 aa  351  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.142053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01856  methyl-accepting protein IV  42.32 
 
 
533 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.293195  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01845  hypothetical protein  42.32 
 
 
533 aa  350  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.282402  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.46 
 
 
555 aa  350  5e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.49 
 
 
555 aa  349  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  47.48 
 
 
557 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.48 
 
 
557 aa  349  7e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1298  methyl-accepting chemotaxis protein II  42.88 
 
 
553 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  42.17 
 
 
533 aa  349  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  47.26 
 
 
557 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0513  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.47 
 
 
586 aa  347  5e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00498581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.5 
 
 
552 aa  344  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4786  methyl-accepting chemotaxis protein I  43.81 
 
 
553 aa  343  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.709187  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2134  methyl-accepting chemotaxis protein II  43.11 
 
 
553 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16019e-17 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.14 
 
 
556 aa  342  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.96835  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1326  methyl-accepting chemotaxis protein II  43.11 
 
 
553 aa  342  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  2.3261e-17 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4939  methyl-accepting chemotaxis protein I  47.35 
 
 
553 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188217  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4946  methyl-accepting chemotaxis protein I  47.56 
 
 
553 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.556415 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4887  methyl-accepting chemotaxis protein I  47.35 
 
 
553 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2074  methyl-accepting chemotaxis protein II  43.24 
 
 
553 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.162752  hitchhiker  0.000345874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1203  methyl-accepting chemotaxis protein II  42.93 
 
 
553 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2079  methyl-accepting chemotaxis protein II  42.93 
 
 
553 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.429347  hitchhiker  1.96177e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3949  methyl-accepting chemotaxis protein I  56.29 
 
 
547 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.51 
 
 
562 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0522685  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3889  methyl-accepting chemotaxis protein I  56 
 
 
547 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3769  methyl-accepting chemotaxis protein I  56 
 
 
547 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3779  methyl-accepting chemotaxis protein  56 
 
 
547 aa  337  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3846  methyl-accepting chemotaxis protein I  56 
 
 
547 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4900  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.45 
 
 
554 aa  335  9e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.979291 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3700  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 
554 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.125609 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01857  methyl-accepting chemotaxis protein II  42.68 
 
 
553 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.13191  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1754  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.68 
 
 
553 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0705276  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.68 
 
 
553 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2624  methyl-accepting chemotaxis protein II  42.86 
 
 
553 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.784316  hitchhiker  0.00000000183949 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1982  methyl-accepting chemotaxis protein II  42.68 
 
 
553 aa  334  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01846  hypothetical protein  42.68 
 
 
553 aa  334  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.186429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5868  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.27 
 
 
554 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4947  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.27 
 
 
554 aa  334  3e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.96 
 
 
537 aa  332  8e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2119  methyl-accepting chemotaxis protein II  42.5 
 
 
553 aa  332  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0158521  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04232  methyl-accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor  42.5 
 
 
551 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3873  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.72 
 
 
575 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.460221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04198  hypothetical protein  42.5 
 
 
551 aa  332  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4586  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.05 
 
 
557 aa  331  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.32 
 
 
551 aa  330  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3679  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.42 
 
 
567 aa  330  6e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4893  methyl-accepting chemotaxis protein I  42.32 
 
 
551 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2308  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.62 
 
 
560 aa  326  8.000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.52721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.03 
 
 
556 aa  325  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0190315  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.66 
 
 
527 aa  323  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.94 
 
 
661 aa  322  8e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.74 
 
 
557 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.46 
 
 
583 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.99 
 
 
560 aa  320  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.86 
 
 
572 aa  320  5e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2179  methyl-accepting chemotaxis protein II  59.55 
 
 
472 aa  320  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.472287  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01378  methyl-accepting chemotaxis protein III, ribose and galactose sensor receptor  52.37 
 
 
546 aa  319  9e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.37 
 
 
546 aa  319  9e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213228  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.47 
 
 
578 aa  319  9e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  52.37 
 
 
546 aa  319  9e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01390  hypothetical protein  52.37 
 
 
546 aa  319  9e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1838  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.31 
 
 
667 aa  319  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1753  methyl-accepting chemotaxis protein III  48.36 
 
 
546 aa  319  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.79367e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  52.07 
 
 
546 aa  318  1e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.07 
 
 
546 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.47 
 
 
556 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.61 
 
 
556 aa  317  3e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1849  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.78 
 
 
570 aa  317  3e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1631  methyl-accepting chemotaxis protein  46.94 
 
 
579 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.69 
 
 
540 aa  317  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1806  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.84 
 
 
652 aa  316  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.67 
 
 
559 aa  316  6e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.24 
 
 
579 aa  316  6e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52 
 
 
557 aa  316  6e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.377261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.44 
 
 
561 aa  316  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  54.06 
 
 
470 aa  316  9e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 
547 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 
547 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.601659  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.92 
 
 
567 aa  315  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3400  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 
547 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.779493 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.19 
 
 
580 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 
547 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  50.54 
 
 
585 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3335  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.54 
 
 
547 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.499063 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 
549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.214895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>