More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1104 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1104  Cof-like hydrolase  100 
 
 
274 aa  567  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000254312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3225  Cof-like hydrolase  62.41 
 
 
273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3083  HAD family hydrolase  62.41 
 
 
273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3044  HAD family hydrolase  62.41 
 
 
273 aa  352  5e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0506  hypothetical protein  57.14 
 
 
272 aa  331  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.670453  normal  0.663931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00398  thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase  57.14 
 
 
272 aa  330  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0482  hydrolase Cof  57.14 
 
 
272 aa  330  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3163  Cof-like hydrolase  57.14 
 
 
272 aa  330  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0560  hypothetical protein  57.14 
 
 
272 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0500  hypothetical protein  57.14 
 
 
272 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0489  hydrolase Cof  57.14 
 
 
272 aa  330  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30895  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0523  hydrolase Cof  57.14 
 
 
272 aa  330  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00402  hypothetical protein  57.14 
 
 
272 aa  330  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0369  hydrolase Cof  57.14 
 
 
272 aa  330  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0913  Cof-like hydrolase  57.14 
 
 
272 aa  330  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0534  hydrolase Cof  56.78 
 
 
272 aa  330  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0516  protein cof  57.14 
 
 
272 aa  329  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0497  protein cof  56.78 
 
 
272 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3169  Cof-like hydrolase  55.56 
 
 
255 aa  300  1e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.103959  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4150  putative sugar phosphatase  41.44 
 
 
266 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000304841  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2932  hypothetical protein  36.98 
 
 
265 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.799578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03705  predicted hydrolase  41.6 
 
 
266 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3960  putative sugar phosphatase  41.44 
 
 
266 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0460666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4182  putative sugar phosphatase  41.6 
 
 
266 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.152006 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03654  hypothetical protein  41.6 
 
 
266 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4193  putative sugar phosphatase  41.6 
 
 
266 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4050  putative sugar phosphatase  41.6 
 
 
266 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4153  Cof-like hydrolase  41.6 
 
 
266 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5267  putative sugar phosphatase  41.6 
 
 
266 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4347  putative sugar phosphatase  41.6 
 
 
266 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4293  putative sugar phosphatase  41.6 
 
 
266 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3970  putative sugar phosphatase  40.46 
 
 
266 aa  188  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35132  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002120  hydrolase (HAD superfamily)  37.45 
 
 
274 aa  187  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0197  Cof-like hydrolase  39.69 
 
 
265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00730737  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0222  putative sugar phosphatase  39.02 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3994  putative sugar phosphatase  39.02 
 
 
269 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0559  putative sugar phosphatase  39.02 
 
 
269 aa  182  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0197  putative sugar phosphatase  39.31 
 
 
266 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.226044  normal  0.0522792 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2386  hypothetical protein  36.7 
 
 
275 aa  180  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00301  hydrolase  36.19 
 
 
270 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  35.36 
 
 
273 aa  175  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3398  Cof-like hydrolase  34.85 
 
 
266 aa  175  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  36.5 
 
 
273 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0246  Cof-like hydrolase  40.08 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.163876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  35.74 
 
 
291 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  34.98 
 
 
273 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  34.6 
 
 
273 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  34.6 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  34.6 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  34.6 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  34.6 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  34.6 
 
 
280 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  34.22 
 
 
273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3291  Cof-like hydrolase  32.58 
 
 
263 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  33.84 
 
 
274 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  33.84 
 
 
274 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  33.84 
 
 
274 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  34.22 
 
 
277 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  34.22 
 
 
291 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2774  Cof-like hydrolase  34.47 
 
 
265 aa  156  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  33.84 
 
 
274 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0777  HAD superfamily hydrolase  32.18 
 
 
272 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00492299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  34.6 
 
 
273 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1228  Cof protein  32.57 
 
 
266 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2727  Cof-like hydrolase  29.46 
 
 
281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0156  Cof-like hydrolase  29.7 
 
 
269 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0069  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.71 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.707164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  26.67 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  32.35 
 
 
268 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0427  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.21 
 
 
279 aa  102  8e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.635472  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  29.22 
 
 
266 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  32.94 
 
 
279 aa  99  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 
269 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  27.7 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  31.67 
 
 
268 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1180  phosphotransferase  31.14 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  25.6 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  28.78 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  26.69 
 
 
276 aa  92.4  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  28.42 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  28.26 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3056  phosphotransferase  28.72 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  29.32 
 
 
272 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  28.26 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  30.74 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  31.73 
 
 
271 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  25.19 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1278  phosphotransferase  29.18 
 
 
273 aa  91.3  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0909  Cof-like hydrolase  25.51 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000198866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2079  HAD superfamily hydrolase  26.14 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00139142  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  29.66 
 
 
268 aa  89.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2934  phosphotransferase  29.14 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1422  phosphotransferase  29.12 
 
 
273 aa  89.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2751  Cof-like hydrolase  25.62 
 
 
272 aa  89.4  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.181052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  29.08 
 
 
271 aa  89  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4183  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.02 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000631727  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1257  phosphotransferase  29.39 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 
274 aa  87.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  31.33 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>