72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0938 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0938  putative urate oxidase, N-terminal  100 
 
 		 166 aa  325  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.456105  normal  0.914947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2781  OHCU decarboxylase  49.39 
 
 		 196 aa  150  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.132757  hitchhiker  0.0000130828 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3569  OHCU decarboxylase  48.48 
 
 		 166 aa  144  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1144  putative urate oxidase, N-terminal  48.17 
 
 		 163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  48.45 
 
 		 825 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3732  putative OHCU decarboxylase  46.06 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3454  putative OHCU decarboxylase  46.67 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08270  OHCU decarboxylase  44.51 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.836682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0114  OHCU decarboxylase  45.73 
 
 		 193 aa  121  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2960  OHCU decarboxylase  42.17 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0720  Oxo-4-hydroxy-4-carboxy-5-ureidoimidazoline decarboxylase  39.64 
 
 		 182 aa  103  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4739  OHCU decarboxylase  41.51 
 
 		 231 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5938  OHCU decarboxylase  38.41 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1332  OHCU decarboxylase  39.31 
 
 		 197 aa  94.4  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2536  OHCU decarboxylase  35.37 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630582  normal  0.368039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4869  putative OHCU decarboxylase  33.33 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0840  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  37.14 
 
 		 516 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5276  putative OHCU decarboxylase  36.2 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.358826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1915  putative OHCU decarboxylase  33.14 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000496427  normal  0.213147 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2069  hypothetical protein  39.38 
 
 		 179 aa  79  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1825  OHCU decarboxylase  33.74 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5680  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  33.52 
 
 		 520 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6772  putative OHCU decarboxylase  30.59 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2771  putative bifunctional allantoicase/OHCU decarboxylase  33.33 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2438  hypothetical protein  30.36 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1308  hypothetical protein  28.14 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.029445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5166  putative OHCU decarboxylase  26.51 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.3304  normal  0.0722696 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0837  OHCU decarboxylase  26.51 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.653813  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2427  hypothetical protein  32.86 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5382  putative OHCU decarboxylase  26.51 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.364924  hitchhiker  0.0064281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02518  uricase-like protein  31.16 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4866  putative OHCU decarboxylase  25.9 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4780  putative OHCU decarboxylase  25.9 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.358879  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1950  hypothetical protein  28.31 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0881  hypothetical protein  27.98 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5277  hypothetical protein  27.71 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0399962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1938  OHCU decarboxylase  28.74 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0640799  normal  0.0392315 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1962  hypothetical protein  27.71 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1986  hypothetical protein  27.71 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.523648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6115  hypothetical protein  27.71 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1877  hypothetical protein  27.71 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.207641  normal  0.107277 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6199  hypothetical protein  35.24 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.270855 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1392  OHCU decarboxylase  28.78 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.165224  normal  0.148489 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2121  hypothetical protein  31.68 
 
 		 173 aa  47.4  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.205363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21120  hypothetical protein  30.3 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.959154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2068  hypothetical protein  28.57 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2328  OHCU decarboxylase  27.27 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.256627 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1780  OHCU decarboxylase  28.31 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.173736 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1927  hypothetical protein  25.3 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00070  conserved hypothetical protein  33 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.531908  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_004310  BR0347  hypothetical protein  27.59 
 
 		 475 aa  45.1  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.399937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0449  chitin deacetylase  34.43 
 
 		 475 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0363  hypothetical protein  27.59 
 
 		 475 aa  45.1  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.851897  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5850  hypothetical protein  30.59 
 
 		 170 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.107994  hitchhiker  0.000262716 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1507  hypothetical protein  27.07 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246416  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2006  hypothetical protein  27.07 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3304  hypothetical protein  27.07 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2387  hypothetical protein  27.07 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2532  chitooligosaccharide deacetylase  27.07 
 
 		 173 aa  44.3  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2431  hypothetical protein  27.07 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5459  OHCU decarboxylase  33.33 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  25.73 
 
 		 592 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29775  predicted protein  27 
 
 		 194 aa  42  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1407  putative OHCU decarboxylase  23.49 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4618  chitin deacetylase  27.48 
 
 		 471 aa  42.4  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.253154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2831  polysaccharide deacetylase  35.59 
 
 		 478 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.729324  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2600  hypothetical protein  28.89 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.562153  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2261  hypothetical protein  25.3 
 
 		 174 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2841  hypothetical protein  27.27 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3151  OHCU decarboxylase  25.38 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5068  urate catabolism protein  30.09 
 
 		 478 aa  40.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0360334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>