More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0447 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0447  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  499  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0450  hypothetical protein  85.83 
 
 
242 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.777332  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4519  hypothetical protein  85.48 
 
 
242 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.13557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1323  hypothetical protein  82.23 
 
 
240 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1289  hypothetical protein  82.23 
 
 
240 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1245  hypothetical protein  82.23 
 
 
240 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3408  hypothetical protein  82.08 
 
 
241 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2724  hypothetical protein  82.08 
 
 
240 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3065  hypothetical protein  81.82 
 
 
240 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574128  hitchhiker  0.0000000411233 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1227  hypothetical protein  80.17 
 
 
240 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3401  hypothetical protein  79.34 
 
 
240 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2410  hypothetical protein  78.75 
 
 
240 aa  396  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1225  hypothetical protein  77.92 
 
 
240 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1086  hypothetical protein  78.1 
 
 
241 aa  394  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1154  hypothetical protein  77.5 
 
 
240 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1155  hypothetical protein  77.92 
 
 
240 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706452  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2063  hypothetical protein  69.42 
 
 
241 aa  344  8e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4169  hypothetical protein  64.88 
 
 
241 aa  341  5e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652416  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03175  hypothetical protein  64.73 
 
 
240 aa  334  5.999999999999999e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1551  hypothetical protein  65.27 
 
 
238 aa  334  7.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00373978  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0124  hypothetical protein  65.83 
 
 
239 aa  331  6e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0550  hypothetical protein  64.71 
 
 
243 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.105783  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0141  hypothetical protein  66.94 
 
 
240 aa  322  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0810  hypothetical protein  62.92 
 
 
240 aa  315  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2154  hypothetical protein  61.83 
 
 
241 aa  315  5e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36352  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07036  hypothetical protein  67.5 
 
 
238 aa  315  6e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2868  hypothetical protein  64.02 
 
 
238 aa  312  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.666015  hitchhiker  0.000154925 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000982  hypothetical protein  69.43 
 
 
227 aa  308  5.9999999999999995e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1104  hypothetical protein  58.75 
 
 
239 aa  298  7e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1066  hypothetical protein  60.08 
 
 
237 aa  293  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0242  hypothetical protein  47.26 
 
 
238 aa  215  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000674117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  46.72 
 
 
242 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0411  hypothetical protein  48.56 
 
 
238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0757755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  45.42 
 
 
239 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4761  hypothetical protein  45.42 
 
 
239 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0615  hypothetical protein  46.72 
 
 
239 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000476022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  46.31 
 
 
239 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  46.31 
 
 
239 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  46.31 
 
 
239 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  46.31 
 
 
239 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  46.31 
 
 
239 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  46.06 
 
 
239 aa  210  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  46.31 
 
 
239 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1645  hypothetical protein  44.73 
 
 
238 aa  208  6e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393041  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0693  hypothetical protein  47.5 
 
 
238 aa  205  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.719863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0708  hypothetical protein  47.5 
 
 
238 aa  205  7e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.934731  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  45.83 
 
 
238 aa  200  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0237  hypothetical protein  45.15 
 
 
238 aa  200  9.999999999999999e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.89365  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl546  hypothetical protein  46.69 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.04209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4750  hypothetical protein  44.3 
 
 
238 aa  198  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.168616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1660  hypothetical protein  44.3 
 
 
238 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  0.0396414 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2106  hypothetical protein  44.3 
 
 
238 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.42847e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0985  hypothetical protein  44.3 
 
 
238 aa  198  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000517844  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2265  hypothetical protein  44.3 
 
 
238 aa  198  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4850  hypothetical protein  44.3 
 
 
238 aa  197  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4826  hypothetical protein  44.3 
 
 
238 aa  197  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01895  hypothetical protein  44.3 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.332684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1670  protein of unknown function DUF28  44.3 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00376814  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1142  hypothetical protein  44.3 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394813  hitchhiker  0.000003904 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01884  hypothetical protein  44.3 
 
 
238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340686  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2825  hypothetical protein  44.54 
 
 
238 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000953652  normal  0.63572 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4901  hypothetical protein  44.54 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4897  hypothetical protein  43.7 
 
 
234 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374047 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0598  hypothetical protein  43.8 
 
 
237 aa  181  1e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.780908  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  37.66 
 
 
246 aa  158  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  40.33 
 
 
246 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  40.33 
 
 
246 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  40.33 
 
 
246 aa  158  8e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  40.33 
 
 
246 aa  158  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  40.33 
 
 
246 aa  158  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  40.33 
 
 
246 aa  158  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  39.92 
 
 
246 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  39.92 
 
 
246 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  40 
 
 
242 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  39.92 
 
 
246 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  39.51 
 
 
247 aa  156  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  39.17 
 
 
248 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  39.92 
 
 
247 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  39.51 
 
 
246 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  37.34 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  40.33 
 
 
246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  39.51 
 
 
246 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  39.51 
 
 
246 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  39.51 
 
 
246 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  39.51 
 
 
246 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  39.17 
 
 
248 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  38.68 
 
 
247 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  39.18 
 
 
247 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  36.36 
 
 
250 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  39.75 
 
 
248 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  39.75 
 
 
248 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  39.75 
 
 
248 aa  152  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  40.16 
 
 
248 aa  151  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  39.18 
 
 
248 aa  152  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  38.84 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  38.43 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  39.34 
 
 
248 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  37.66 
 
 
246 aa  150  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  41.85 
 
 
242 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  36.13 
 
 
246 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>