More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5041 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 148 aa  300  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  48.82 
 
 		 291 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4458  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  44.55 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2175  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.523963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  31.58 
 
 		 313 aa  67  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.48 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.48 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.45 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.48 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  39.78 
 
 		 329 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  39.78 
 
 		 329 aa  63.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  32.77 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  42.39 
 
 		 312 aa  62  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  30.71 
 
 		 321 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  33.93 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.41 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  35.19 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  30.77 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.11 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.41 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.41 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.11 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  36.7 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  36.7 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  36.52 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  29.31 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.41 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  36.26 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  33.33 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  33.33 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  35.48 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  39.81 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  36.7 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.29 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.29 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  34.31 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.33 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.29 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.14 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  34.95 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  36 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  34.29 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  29.93 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2346  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  34.95 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  33.04 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  34.95 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  29.46 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2666  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  34.44 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  34.48 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  30.51 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  34.31 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.53 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  34.07 
 
 		 316 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 313 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  31.09 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  35.87 
 
 		 310 aa  57  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  35.71 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  35.71 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  32.14 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.02 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.62 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  34.65 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  30.91 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  34.62 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>