64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4191 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4191  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
304 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935651  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4758  hypothetical protein  48.42 
 
 
358 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.112624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2626  hypothetical protein  48.06 
 
 
347 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2847  hypothetical protein  38.36 
 
 
299 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367505  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4831  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.46 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1863  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.29 
 
 
392 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.97552  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3363  hypothetical protein  33.55 
 
 
321 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0719633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.44 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3554  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.56 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07085  hypothetical protein  24.75 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1868  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.78 
 
 
335 aa  73.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0536767  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0208  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.78 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0210  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 
323 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0484  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.47 
 
 
370 aa  63.5  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0945  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.16 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0928  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.16 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0656  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.11 
 
 
348 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0699  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
323 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.803628  normal  0.0194962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.95 
 
 
269 aa  59.3  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1072  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.06 
 
 
314 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1092  normal  0.788478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0544  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 
344 aa  57  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0103771  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10000  hypothetical protein  38.32 
 
 
365 aa  57  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2919  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.37 
 
 
312 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384293  hitchhiker  0.000191262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1678  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.71 
 
 
331 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1227  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.08 
 
 
371 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0187957  normal  0.460872 
 
 
-
 
NC_002950  PG1402  AP endonuclease domain-containing protein  22.85 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0858  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.41 
 
 
371 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1921  metal-dependent hydrolase  26.96 
 
 
320 aa  52.8  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1883  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.82 
 
 
357 aa  52.4  0.000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.95616  hitchhiker  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3419  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  22.05 
 
 
339 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3086  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0350421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.94 
 
 
261 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.21 
 
 
242 aa  50.4  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0960  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.63 
 
 
327 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0347  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.95 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.53 
 
 
282 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2779  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.86 
 
 
310 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2500  hypothetical protein  25.1 
 
 
334 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0903661  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.28 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1212  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 
372 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.2 
 
 
639 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.81 
 
 
328 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.09 
 
 
837 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  25.9 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.48 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1281  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.11 
 
 
253 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.48 
 
 
255 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  25.61 
 
 
639 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.14 
 
 
245 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2674  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.21 
 
 
344 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.452558  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10258  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.24 
 
 
365 aa  43.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00476343  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001400  hypothetical protein  24.84 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  26.57 
 
 
270 aa  43.1  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.58 
 
 
232 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0327  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.79 
 
 
343 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000168371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36 
 
 
278 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 
808 aa  42.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24830  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.91 
 
 
276 aa  42.7  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3933  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 
318 aa  42.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.66 
 
 
252 aa  42.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  26.64 
 
 
591 aa  42.4  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>