119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2741 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  58.05 
 
 		 241 aa  231  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  53.36 
 
 		 316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  48.92 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  49.35 
 
 		 244 aa  191  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  49.35 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  49.57 
 
 		 253 aa  188  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  48.28 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  51.8 
 
 		 268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  48.2 
 
 		 150 aa  118  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  41.73 
 
 		 193 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  40.27 
 
 		 155 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  38.22 
 
 		 169 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  40.56 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  33.57 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  35.57 
 
 		 169 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  37.59 
 
 		 156 aa  72  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  32.61 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  32.64 
 
 		 153 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  30.94 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  32.28 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  32.28 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  32.28 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  32.17 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0959  hypothetical protein  55.74 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.498536 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  45.83 
 
 		 380 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 		 380 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  52.46 
 
 		 370 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1249  integrase, catalytic region  39.74 
 
 		 246 aa  52  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0925898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  49.25 
 
 		 386 aa  52  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  49.25 
 
 		 386 aa  52  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  45.59 
 
 		 386 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  39.74 
 
 		 317 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  49.18 
 
 		 385 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  49.18 
 
 		 385 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  44.59 
 
 		 385 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  44.59 
 
 		 386 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  44.59 
 
 		 385 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  28.38 
 
 		 157 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  47.54 
 
 		 385 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 386 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  45.9 
 
 		 386 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0065  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 479 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0573  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 479 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2030  integrase catalytic subunit  46.97 
 
 		 479 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0022  IS30, transposase  42.25 
 
 		 383 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2241  Integrase catalytic region  42.25 
 
 		 383 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.954836  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3350  Integrase catalytic region  42.25 
 
 		 383 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3717  Integrase catalytic region  42.25 
 
 		 383 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0736  integrase catalytic region  42.25 
 
 		 383 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2254  integrase catalytic region  42.25 
 
 		 383 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.173899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2624  integrase catalytic region  42.25 
 
 		 383 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.639858  hitchhiker  0.000399148 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03536  IS30 transposase  42.25 
 
 		 374 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.727826  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  45.9 
 
 		 342 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3408  putative transposase IS30  42.25 
 
 		 320 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03481  hypothetical protein  42.25 
 
 		 374 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  46.81 
 
 		 343 aa  45.4  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  45.9 
 
 		 386 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 342 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 342 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  42.03 
 
 		 342 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  42.03 
 
 		 342 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  42.03 
 
 		 342 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  42.03 
 
 		 342 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  42.03 
 
 		 342 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  42.03 
 
 		 342 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  42.03 
 
 		 342 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  49.18 
 
 		 386 aa  45.1  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4666  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 474 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5430  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 414 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.270049 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5505  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 474 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5603  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 437 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.155715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5827  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 437 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.382461 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5906  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 474 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.872405  normal  0.876149 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5986  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 437 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996112 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6004  integrase catalytic subunit  44 
 
 		 437 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000366902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1815  integrase catalytic subunit  38.33 
 
 		 335 aa  44.3  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.284311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2652  integrase catalytic subunit  38.33 
 
 		 335 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.888007  normal  0.0370521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3886  transposase InsI for insertion sequence element IS30B/C/D  42.25 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2157  integrase catalytic subunit  31.17 
 
 		 342 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.100699  normal  0.0600961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  22.63 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1164  integrase catalytic subunit  38.33 
 
 		 335 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.504403  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1485  integrase catalytic subunit  38.33 
 
 		 335 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436949  normal  0.458814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2599  integrase catalytic subunit  38.33 
 
 		 335 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0696438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  46.77 
 
 		 401 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  47.69 
 
 		 401 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0582  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633094 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1446  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1496  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1723  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2801  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2900  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3368  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3807  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.123497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4006  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4011  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5592  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6732  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.120235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6913  integrase catalytic region  36.61 
 
 		 466 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  25.71 
 
 		 153 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>