More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2237 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2237  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
206 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0264903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2238  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  68.45 
 
 
206 aa  277  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44653  normal  0.0272312 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6040  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.87 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8263  homoserine/homoserine lactone efflux protein  38.73 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0435022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0614  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  44.65 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.355661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2562  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
211 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1031  hypothetical protein  31.34 
 
 
212 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2025  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 
208 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.464731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1333  lysine exporter protein LysE/YggA  30.95 
 
 
212 aa  88.2  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2313  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.38 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00564099  hitchhiker  0.00590082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2300  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.735083  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  34.85 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2073  lysine exporter protein LysE/YggA  29.38 
 
 
208 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  0.299626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0867  lysine exporter protein LysE/YggA  31.6 
 
 
207 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.627781  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  34.85 
 
 
242 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  32.08 
 
 
207 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  29.53 
 
 
209 aa  86.3  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2786  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.85 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3591  lysine exporter protein LysE/YggA  34.98 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5436  lysine exporter protein LysE/YggA  34.98 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  24.02 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  36.63 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
208 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1388  amino acid transporter LysE  33.01 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501572  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  27.84 
 
 
210 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3961  lysine exporter protein LysE/YggA  28.14 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3778  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.14 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  37.41 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.272931  normal  0.707068 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  30.24 
 
 
211 aa  82  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0836  lysine exporter protein LysE/YggA  30.99 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2043  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.64 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000125036  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  32.5 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003627  putative threonine efflux protein  30.35 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0490  lysine exporter protein LysE/YggA  27.64 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.64 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1483  lysine exporter protein LysE/YggA  29.32 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  29.77 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2495  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.38 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000331121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  27.5 
 
 
213 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.2 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4824  lysine exporter protein LysE/YggA  30.27 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.322328  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4075  LysE family efflux protein  30.52 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.99 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0905  hypothetical protein  28.44 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.772442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0531  lysine exporter protein LysE/YggA  28.5 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  25.89 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3964  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.15 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  35.27 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003307  putative threonine efflux protein  27.49 
 
 
208 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0921  putative threonine efflux protein  28.79 
 
 
205 aa  75.5  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4453  lysine exporter protein LysE/YggA  31.44 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  34.02 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2019  lysine exporter protein LysE/YggA  29.82 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.318946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.99 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4133  lysine exporter protein LysE/YggA  29.59 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4264  lysine exporter protein LysE/YggA  29.59 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269909  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  29.47 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  25.91 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  26.42 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4465  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  24.51 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0530  amino acid transporter LysE  26.09 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3227  lysine exporter protein LysE/YggA  30.2 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  25.51 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  25.89 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  25.39 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4180  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  25.39 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0556  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.41 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.97 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2500  lysine exporter protein LysE/YggA  31.9 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106725  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 
218 aa  72  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  25.39 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  25.39 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  25.39 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  33.02 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1467  lysine exporter protein LysE/YggA  28.57 
 
 
210 aa  72  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2383  homoserine/threonine efflux protein, putative  26.46 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168172  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1611  lysine exporter protein LysE/YggA  29.56 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0311017  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  28.5 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3063  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.8 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2401  lysine exporter protein LysE/YggA  27.08 
 
 
206 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829988 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  34.81 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.85 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3633  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.05 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0286  lysine exporter protein LysE/YggA  25.77 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.18 
 
 
205 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  28.72 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  27.94 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  35.92 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3097  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.55 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179524  hitchhiker  0.00000160159 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  24.35 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.81 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1194  amino acid transporter LysE  31.64 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00235397  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0989  lysine exporter protein LysE/YggA  29.72 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1385  LysE family amino acid efflux protein  36.77 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.159501  normal  0.0685235 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6476  lysine exporter protein LysE/YggA  31.88 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.772782 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  32.86 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>