More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1829 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1829  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
460 aa  898    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.718577  normal  0.203156 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1265  SN-glycerol-3-phosphate transmembrane ABC transporter protein  38.36 
 
 
293 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
293 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0106698  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1186  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
293 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0963268  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
292 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
293 aa  167  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3696  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  39.15 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3020  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.42 
 
 
319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3725  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  39.15 
 
 
322 aa  166  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3210  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.15 
 
 
294 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0692597  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1761  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.15 
 
 
294 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3754  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpA  39.15 
 
 
294 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2793  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  39.15 
 
 
294 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1696  hypothetical protein  37.93 
 
 
292 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.61 
 
 
293 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.689523  normal  0.199959 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3284  maltose-binding periplasmic protein  31.79 
 
 
293 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588261  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
292 aa  163  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161235  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2015  sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein  40.52 
 
 
293 aa  163  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.960254  normal  0.0166365 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3289  ABC glycerol-3-phosphate transporter, inner membrane subunit UgpA  31.5 
 
 
293 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
294 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526035  normal  0.0342542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
304 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2711  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
294 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.691644  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
294 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
294 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1695  hypothetical protein  37.34 
 
 
292 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3493  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.89 
 
 
294 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
293 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0447  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  39.15 
 
 
294 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.316903  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
294 aa  161  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
313 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
293 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
294 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
293 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0656  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
293 aa  159  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0618  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
293 aa  159  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
293 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
293 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.66 
 
 
293 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
313 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.8 
 
 
293 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0527607  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
293 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
297 aa  155  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.654784 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0348  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  36.91 
 
 
294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0406  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
293 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0112  putative sugar ABC transporter (permease protein)  37.45 
 
 
293 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
293 aa  152  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.16436  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.9 
 
 
293 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.412019  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.65 
 
 
293 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0543502  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
294 aa  151  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0572034  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 
294 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
292 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3654  glycerol-3-phosphate transporter permease  32.97 
 
 
295 aa  147  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.702231 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3961  glycerol-3-phosphate transporter permease  32.97 
 
 
295 aa  147  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0257  glycerol-3-phosphate transporter permease  32.97 
 
 
295 aa  147  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.9 
 
 
290 aa  146  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00066862  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.61 
 
 
288 aa  146  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.967188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
288 aa  144  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06397  hypothetical protein  34.47 
 
 
293 aa  143  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 
294 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.53764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.52 
 
 
294 aa  143  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.580675  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0235  glycerol-3-phosphate transporter permease  29.36 
 
 
295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  39.27 
 
 
307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0126  glycerol-3-phosphate transporter permease  31.25 
 
 
295 aa  140  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
293 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
316 aa  138  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.141538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0118  glycerol-3-phosphate transporter permease  31.99 
 
 
295 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2094  sn-glycerol-3-phosphate transport system, binding protein inner membrane component  34.96 
 
 
293 aa  137  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236232  normal  0.396031 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0720  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.9 
 
 
290 aa  136  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.978604  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.05 
 
 
322 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.518821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0332234  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1156  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 
293 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.87 
 
 
318 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3927  glycerol-3-phosphate transporter permease  32.23 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.961515 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3758  glycerol-3-phosphate transporter permease  32.23 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4766  glycerol-3-phosphate transporter permease  32.23 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.862784  normal  0.380759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3747  glycerol-3-phosphate transporter permease  32.23 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3868  glycerol-3-phosphate transporter permease  32.23 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3825  glycerol-3-phosphate transporter permease  32.23 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3930  glycerol-3-phosphate transporter permease  31.87 
 
 
295 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3731  glycerol-3-phosphate transporter permease  31.5 
 
 
295 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03301  glycerol-3-phosphate transporter subunit  31.5 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03254  hypothetical protein  31.5 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0264  glycerol-3-phosphate transporter permease  31.5 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.332041  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3649  glycerol-3-phosphate transporter permease  31.5 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0890714  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.94 
 
 
320 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.98 
 
 
308 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3871  glycerol-3-phosphate transporter permease  31.14 
 
 
295 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3860  glycerol-3-phosphate transporter permease  29.6 
 
 
295 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3855  glycerol-3-phosphate transporter permease  32.23 
 
 
295 aa  123  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.601717 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4044  glycerol-3-phosphate transporter permease  29.8 
 
 
295 aa  122  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
309 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  36.73 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  27.49 
 
 
310 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  27.49 
 
 
310 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>