111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1159 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1159  domain of unknown function DUF1738  100 
 
 		 389 aa  786    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4151  domain of unknown function DUF1738  29.71 
 
 		 296 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0034  putative DNA replication primase  27.86 
 
 		 682 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000123462  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1648  domain of unknown function DUF1738  27.48 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4668  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1077 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0020  DNA primase TraC  27.87 
 
 		 986 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6616  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1448 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0777828  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2244  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1495 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6521  TOPRIM  26.93 
 
 		 1448 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2529  hypothetical protein  27.75 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0235  domain of unknown function DUF1738  25.82 
 
 		 1716 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4248  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1580 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00909879  normal  0.515927 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1304  domain of unknown function DUF1738  26.97 
 
 		 1457 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000590213 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1615  DNA primase TraC  25.92 
 
 		 1449 aa  96.3  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1461  domain of unknown function DUF1738  25.22 
 
 		 297 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0395  hypothetical protein  25.72 
 
 		 344 aa  89.7  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.877999  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4058  hypothetical protein  24.5 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4587  hypothetical protein  28.66 
 
 		 434 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.37704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4138  hypothetical protein  23.56 
 
 		 320 aa  86.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4123  hypothetical protein  24.65 
 
 		 335 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4426  hypothetical protein  28.25 
 
 		 332 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000360955  normal  0.236857 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4610  hypothetical protein  28.25 
 
 		 332 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939593  normal  0.41393 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4401  domain of unknown function DUF1738  27.92 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.505635  normal  0.161946 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3932  hypothetical protein  24.12 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0574  antirestriction protein  25.31 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1473  domain of unknown function DUF1738  25.55 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0128  antirestriction protein  28.29 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1266  hypothetical protein  31.84 
 
 		 660 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.678844  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0427  antirestriction protein  25.41 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.338701 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4521  domain of unknown function DUF1738  25.5 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000111703  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4417  domain of unknown function DUF1738  25.5 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000308922  normal  0.463356 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4029  peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site  25.23 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1780  antirestriction protein  25.28 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.114291  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6843  domain of unknown function DUF1738  25.31 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.896751  normal  0.17936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1972  domain of unknown function DUF1738  24.93 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0738445  normal  0.0525568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0255  antirestriction protein  24.78 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2664  replication primases  22.95 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8295  domain of unknown function DUF1738  25.07 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399219  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6049  hypothetical protein  24.71 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3779  hypothetical protein  25.37 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.694827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6336  domain of unknown function DUF1738  25.57 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3581  hypothetical protein  23.03 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3033  DNA primase  22.78 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828057 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2455  domain of unknown function DUF1738  25.66 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  unclonable  0.000000000352571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3034  hypothetical protein  30.46 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6717  domain of unknown function DUF1738  25.69 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000323608  normal  0.58549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1814  hypothetical protein  24.11 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_19  putative antirestriction protein  24.29 
 
 		 328 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366429  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4018  hypothetical protein  22.7 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.366526  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3690  antirestriction protein  21.92 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0021  antirestriction protein  25.29 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3793  hypothetical protein  24.07 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3741  hypothetical protein  21.68 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1960  domain of unknown function DUF1738  23.87 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1544  hypothetical protein  25.44 
 
 		 320 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0398449 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3267  hypothetical protein  23.24 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.488667  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3149  hypothetical protein  25.82 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1844  protein of unknown function DUF1738  25.08 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.779395 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3508  hypothetical protein  22.82 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9564  antirestriction protein  22.78 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211525  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_25  antirestriction protein ArdC  29.83 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2408  domain of unknown function DUF1738  24.64 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0038447  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0539  hypothetical protein  23.65 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9909  antirestriction protein  23.17 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5500  domain of unknown function DUF1738  24.48 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.348911 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5261  hypothetical protein  23.26 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.798907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0801  hypothetical protein  21.14 
 
 		 308 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.957883 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5558  domain of unknown function DUF1738  23.44 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.476412  normal  0.0470037 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4322  hypothetical protein  26.37 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2959  hypothetical protein  24.29 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409787  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4483  ArdC gene in pSa(IncW plasmid)-like  24.92 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00889579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7703  putative ardC antirestriction protein  23.96 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.166875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0639  hypothetical protein  27.46 
 
 		 276 aa  67  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3921  antirestriction protein; ArdC  23.31 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1223  hypothetical protein  23.98 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.909972  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3512  hypothetical protein  23.98 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.126742  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4749  domain of unknown function DUF1738  24.83 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.778127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5920  domain of unknown function DUF1738  25.57 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2121  antirestriction protein; ArdC  22.78 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4973  domain of unknown function DUF1738  22.31 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4757  hypothetical protein  23.7 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0527  hypothetical protein  24.45 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.989296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3059  protein of unknown function DUF1738  23.96 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0037  hypothetical protein  23.26 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.145058  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2363  domain of unknown function DUF1738  28.12 
 
 		 275 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3814  hypothetical protein  23.21 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0877775  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0279  putative conjugal transfer antirestriction protein  23.15 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3326  putative ardC antirestriction protein  23.89 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3336  hypothetical protein  22.79 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8099  antirestriction protein  23.78 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0381  putative ArdC antirestriction protein  30.77 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4227  antirestriction protein  30.83 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0722776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3213  antirestriction protein-like  28.22 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9173  antirestriction protein  23.84 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.12033  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4545  hypothetical protein  29.75 
 
 		 295 aa  57  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2009  antirestriction protein-like protein  33.07 
 
 		 147 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.538486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7394  putative ardC antirestriction protein  30.71 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4588  hypothetical protein  20.52 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3568  antirestriction protein; ArdC  27.27 
 
 		 316 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.883646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5543  domain of unknown function DUF1738  24.73 
 
 		 306 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234849  hitchhiker  0.00000802915 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>