More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5455 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5455  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354613  normal  0.536806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0298  hypothetical protein  36.27 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9147  Sugar kinase ribokinase family  34.32 
 
 		 288 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3945  carbohydrate kinase, PfkB  34.72 
 
 		 285 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3914  PfkB domain-containing protein  28.68 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3872  PfkB domain protein  28.31 
 
 		 281 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3975  PfkB domain-containing protein  28.31 
 
 		 281 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.971364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3806  PfkB domain protein  28.31 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3794  PfkB domain protein  28.31 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  34.75 
 
 		 261 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  34.36 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  34.36 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  34.36 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  34.36 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  34.75 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  34.36 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3647  xylose isomerase domain-containing protein  32.43 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0212849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2845  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.50461  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  33.33 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  28.71 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.85 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  31.68 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.4 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2588  PfkB domain-containing protein  30.74 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.02383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  31.1 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2848  ketohexokinase  28.85 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  30.04 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  28.27 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  30.04 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  27.92 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  29.33 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  28.47 
 
 		 319 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0095  PfkB domain protein  28.42 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39540  sugar kinase, ribokinase  29.82 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.893162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.31 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0983  PfkB domain protein  30 
 
 		 322 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  28.25 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  27.31 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  28.63 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  27.38 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  28.2 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3544  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3539  PfkB  28.85 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.460191  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  29 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3612  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  28.12 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  28.83 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  26.74 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  26.74 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  31.64 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  27.39 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  25.26 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0691  ribokinase family sugar kinase  24.03 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00280887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.32 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  27.6 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  26.32 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  24.81 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  23.11 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03203  Sugar kinase, ribokinase family protein  24.11 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00908389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  28.24 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  32.06 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  27.65 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  31.15 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  30 
 
 		 333 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  28.57 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1060  PfkB  26.95 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7479  ribokinase  26.95 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1540  ribokinase-like domain-containing protein  26.95 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1516  ribokinase-like domain-containing protein  26.95 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115005  normal  0.017116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  30.69 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  27.96 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  29.76 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  25.8 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5895  sugar kinase, putative  30.43 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  0.0122717 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  23.39 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  29.46 
 
 		 320 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  28.08 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  25.8 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  28.83 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  29.46 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  27.14 
 
 		 302 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  31.68 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  25.76 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  27.68 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  28.95 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  27.38 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  23.53 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  29.48 
 
 		 331 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  28 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0052  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000666375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3132  ribokinase-like domain-containing protein  27.27 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509823 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.96 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  27.61 
 
 		 302 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  26.25 
 
 		 319 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  25.29 
 
 		 301 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  26.96 
 
 		 310 aa  52.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.16 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  23.53 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>