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for query gene Smed_5332 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5332  major facilitator transporter  100 
 
 		 393 aa  757    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0526  major facilitator family transporter  32.35 
 
 		 503 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2646  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 401 aa  144  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.845364  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2507  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0250  major facilitator family transporter  32.68 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290023  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0940  major facilitator family transporter  32.68 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.566015  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1433  major facilitator family transporter  32.68 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0286  major facilitator family transporter  32.68 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1630  major facilitator family transporter  32.68 
 
 		 401 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  31.89 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  30.58 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.65 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.9 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.35 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.21 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.43 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.43 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 		 416 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  31.35 
 
 		 416 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.04 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.93 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.94 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.57 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  30.57 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.08 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  28.25 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  31.08 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  31.08 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.59 
 
 		 409 aa  100  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3518  MFS permease  28.68 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.19 
 
 		 401 aa  99.8  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.68 
 
 		 393 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  29.2 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
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NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  26.96 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.01 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_2062  inner membrane transport protein YdhC  28.47 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0300208  hitchhiker  0.0000445081 
 
 
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NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.67 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.27 
 
 		 425 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.73 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1975  inner membrane transport protein YdhC  28.11 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00432346  normal  0.238152 
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.42 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2017  bicyclomycin resistance protein  29.15 
 
 		 401 aa  98.2  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.470067  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_0922  inner membrane transport protein YdhC  29.34 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  28.96 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2001  inner membrane transport protein YdhC  27.76 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.330416  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2399  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.15 
 
 		 457 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.35739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.38 
 
 		 438 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  25.32 
 
 		 397 aa  96.7  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.15 
 
 		 414 aa  96.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.98 
 
 		 409 aa  96.7  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.55 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_0598  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.94 
 
 		 402 aa  96.3  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  26.35 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_2373  inner membrane transport protein YdhC  29.17 
 
 		 423 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.4 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_00358  permease  25.52 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_002978  WD0248  drug resistance transporter  23.37 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.46 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2519  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.632928 
 
 
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NC_010506  Swoo_1956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.59 
 
 		 408 aa  92.8  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.587196  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.23 
 
 		 411 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009715  CCV52592_0947  drug resistance transporter  24.81 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1912  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.52 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2665  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.2 
 
 		 408 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0126331  hitchhiker  0.00560959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  27.33 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.1 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.1 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.1 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.67 
 
 		 435 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.24 
 
 		 436 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.74 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.88 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.44 
 
 		 407 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4089  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1475  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.33 
 
 		 392 aa  90.1  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200564 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1377  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.14 
 
 		 406 aa  89.7  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000229631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1761  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.22 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3344  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.84 
 
 		 411 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0616341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.32 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2692  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.84 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.1 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.9 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.26 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.59 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1999  inner membrane transport protein YdhC  29.24 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00228821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.27 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4889  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.5 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_6143  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.04 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.83 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2203  inner membrane transport protein YdhC  28.67 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00024069  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.82 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_2168  inner membrane transport protein YdhC  28.67 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00660024  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_2311  inner membrane transport protein YdhC  28.67 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0216874  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_32370  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily protein  27.11 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.46 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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