155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4271 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4271  3-methyladenine DNA glycosylase  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1264  3-methyladenine DNA glycosylase  62.92 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.754746  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1432  3-methyladenine DNA glycosylase  62.5 
 
 		 181 aa  223  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.906  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6283  DNA-3-methyladenine glycosylase  61.14 
 
 		 182 aa  222  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2339  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.11 
 
 		 189 aa  210  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296138  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0935  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.56 
 
 		 208 aa  209  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.231769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0896  DNA-3-methyladenine glycosylase  58.99 
 
 		 208 aa  207  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2889  3-methyladenine DNA glycosylase  58.1 
 
 		 201 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1042  3-methyladenine DNA glycosylase  56.52 
 
 		 184 aa  205  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0126779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0871  DNA-3-methyladenine glycosylase  59.66 
 
 		 192 aa  204  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2381  3-methyladenine DNA glycosylase  56.52 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2856  3-methyladenine DNA glycosylase  56.42 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.371559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4418  DNA-3-methyladenine glycosylase  60.11 
 
 		 189 aa  203  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0788  DNA-3-methyladenine glycosylase  61.02 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5540  DNA-3-methyladenine glycosylase  61.02 
 
 		 189 aa  202  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1894  3-methyladenine DNA glycosylase  56.74 
 
 		 184 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754193  normal  0.935927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3948  3-methyladenine DNA glycosylase  56.98 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2583  3-methyladenine DNA glycosylase  54.75 
 
 		 202 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.694841  normal  0.011747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4272  DNA-3-methyladenine glycosylase  59.77 
 
 		 203 aa  198  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2571  3-methyladenine DNA glycosylase  56.11 
 
 		 224 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3102  3-methyladenine DNA glycosylase  56.25 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0295366 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3360  3-methyladenine DNA glycosylase  54.24 
 
 		 205 aa  190  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0162984 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1438  3-methyladenine DNA glycosylase  55.31 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.180983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1830  3-methyladenine DNA glycosylase  52.22 
 
 		 206 aa  164  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.688106  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0903  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.24 
 
 		 192 aa  148  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3543  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.6 
 
 		 204 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.241526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2161  3-methyladenine DNA glycosylase  45.9 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2775  3-methyladenine DNA glycosylase  45.9 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.539823  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1635  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.08 
 
 		 190 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0540  3-methyladenine DNA glycosylase  46.45 
 
 		 258 aa  140  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6105  3-methyladenine DNA glycosylase  43.72 
 
 		 207 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2786  3-methyladenine DNA glycosylase  44.81 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4447  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.4 
 
 		 216 aa  134  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.272988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2389  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.29 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0121289  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1057  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.29 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0826  3-methyladenine DNA glycosylase  38.69 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0773  3-methyladenine DNA glycosylase  38.69 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0869  3-methyladenine DNA glycosylase  38.69 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0960  3-methyladenine DNA glycosylase  38.69 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4408  3-methyladenine DNA glycosylase  39.2 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0959  3-methyladenine DNA glycosylase  38.69 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1048  3-methyladenine DNA glycosylase  38.19 
 
 		 205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.467167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5463  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.25 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00957524  decreased coverage  0.00095084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2159  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.92 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000743794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0774  3-methyladenine DNA glycosylase  38.69 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6069  3-methyladenine DNA glycosylase  43.72 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1309  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.83 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0425543  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1255  3-methyladenine DNA glycosylase  42.47 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.139992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0703  3-methyladenine DNA glycosylase  39.39 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0774  3-methyladenine DNA glycosylase  38.38 
 
 		 204 aa  122  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2393  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.01 
 
 		 192 aa  121  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.412729  normal  0.610671 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0321  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  42.27 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0107419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0922  3-methyladenine DNA glycosylase  37.19 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.904428  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1170  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.3 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1896  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.26 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2098  DNA-3-methyladenine glycosylase  40.54 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3569  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.87 
 
 		 205 aa  117  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.869839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1011  3-methyladenine DNA glycosylase  40.59 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.836846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2088  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.46 
 
 		 199 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4712  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.56 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0079  DNA-3-methyladenine glycosylase II  41.53 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0710  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.11 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2275  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.48 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0611  DNA-3-methyladenine glycosylase  42.5 
 
 		 199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.307609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1890  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.07 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118243  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1508  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.86 
 
 		 217 aa  111  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14598  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1529  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.38 
 
 		 216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3167  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.75 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0780457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2023  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.23 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.319248 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1889  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.63 
 
 		 208 aa  108  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0224  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.96 
 
 		 262 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3154  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.67 
 
 		 215 aa  107  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1802  methylpurine-DNA glycosylase (MPG)  38.86 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.856729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4364  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.28 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.45851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1651  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.65 
 
 		 240 aa  104  7e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4231  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.74 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625933  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1509  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.58 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000383053 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4387  DNA-3-methyladenine glycosylase  45.74 
 
 		 210 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2057  DNA-3-methyladenine glycosylase  38.95 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2476  3-methyladenine DNA glycosylase  42.05 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1745  DNA-3-methyladenine glycosylase  35.78 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5448  DNA-3-methyladenine glycosylase  46.54 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25550  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.36 
 
 		 212 aa  101  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1650  3-methyladenine DNA glycosylase  36.04 
 
 		 217 aa  101  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.9528e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3295  3-methyladenine DNA glycosylase  40.46 
 
 		 203 aa  100  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.619589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1335  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.38 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377862  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3642  DNA-3-methyladenine glycosylase  34.02 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0929  hypothetical protein  36.17 
 
 		 183 aa  99  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1611  3-methyladenine DNA glycosylase  34.03 
 
 		 198 aa  99  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.289887  normal  0.460246 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4380  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.98 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0981319 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0669  DNA-3-methyladenine glycosylase  41.61 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.310444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0750  3-methyladenine DNA glycosylase  31.69 
 
 		 189 aa  98.6  5e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0898  hypothetical protein  36.32 
 
 		 183 aa  98.2  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0785  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.07 
 
 		 201 aa  98.2  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4123  DNA-3-methyladenine glycosylase  39.78 
 
 		 211 aa  98.2  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.069572  hitchhiker  0.000036152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1276  DNA-3-methyladenine glycosylase  37.44 
 
 		 221 aa  97.8  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158015  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3021  DNA-3-methyladenine glycosylase  44.52 
 
 		 214 aa  97.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1287  DNA-3-methyladenine glycosylase  43.65 
 
 		 210 aa  97.1  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2901  3-methyladenine DNA glycosylase  32.5 
 
 		 205 aa  96.3  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11704  3-methyladenine DNA glycosylase  37.57 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.336317 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>