58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3023 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3023  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  636    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.281163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4216  hypothetical protein  47.17 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3892  hypothetical protein  46.88 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0691561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3265  hypothetical protein  39.16 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2527  hypothetical protein  33.63 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103788 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2257  hypothetical protein  32.11 
 
 		 270 aa  89.4  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.992674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3565  hypothetical protein  31.25 
 
 		 261 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2668  hypothetical protein  35.35 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.681944  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0081  hypothetical protein  32.37 
 
 		 272 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3470  hypothetical protein  39.74 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.795645  normal  0.514774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1731  hypothetical protein  30.39 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151489  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2985  hypothetical protein  37.28 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2197  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0071  hypothetical protein  31.95 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2004  hypothetical protein  32.26 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1121  hypothetical protein  32.86 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1073  hypothetical protein  39.06 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.245832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1901  hypothetical protein  31.94 
 
 		 262 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1560  hypothetical protein  31.08 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2012  hypothetical protein  30.94 
 
 		 259 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2400  hypothetical protein  28.64 
 
 		 244 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  31.77 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1536  hypothetical protein  29.82 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3382  hypothetical protein  27.36 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0142115  normal  0.996746 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1333  hypothetical protein  32.45 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  29.74 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0810  hypothetical protein  30.34 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.469295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5155  hypothetical protein  33.99 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4289  hypothetical protein  38.57 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.817777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5399  hypothetical protein  28.33 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4498  hypothetical protein  36.36 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3145  hypothetical protein  29.82 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1829  hypothetical protein  28.19 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.727935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1534  SOS cell division inhibitor SulA  34.91 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190515  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4947  hypothetical protein  26.34 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5605  hypothetical protein  33.84 
 
 		 252 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00198134 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  27.65 
 
 		 229 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  29.17 
 
 		 236 aa  49.3  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  30.89 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  30.93 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  28.91 
 
 		 207 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  29.07 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2296  hypothetical protein  28.44 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  28.22 
 
 		 214 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  28.22 
 
 		 214 aa  46.6  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  29.07 
 
 		 235 aa  45.8  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  28.48 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  28.82 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  28.82 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  27.81 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  31.52 
 
 		 204 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  28.48 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  25.62 
 
 		 234 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  28.57 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  30 
 
 		 238 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  43.1  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  30.26 
 
 		 254 aa  42.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  27.81 
 
 		 253 aa  42.7  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.647715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>