More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0346 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0346  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 447 aa  905    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0940118 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  31.99 
 
 		 426 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  31.99 
 
 		 426 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0475  acetylornithine deacetylase  31.99 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0410  acetylornithine deacetylase  32.24 
 
 		 424 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0548  acetylornithine deacetylase  32.74 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166552  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0497  acetylornithine deacetylase  31.65 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00375868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0548  acetylornithine deacetylase  31.74 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000707223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4825  acetylornithine deacetylase  31.9 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0895557  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  31.49 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0412  acetylornithine deacetylase  32.49 
 
 		 424 aa  189  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0810  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.78 
 
 		 447 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  31.84 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.18 
 
 		 424 aa  159  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  28.47 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0025  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.99 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.22 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  30.28 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  31.17 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  30.28 
 
 		 422 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  30.28 
 
 		 422 aa  150  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  30.28 
 
 		 422 aa  150  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  29.72 
 
 		 422 aa  149  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  29.72 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  30 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  27.99 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.68 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  29.72 
 
 		 422 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.33 
 
 		 428 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  29.67 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.24 
 
 		 426 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.41 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30.89 
 
 		 463 aa  129  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0949  peptidase M20  29.5 
 
 		 424 aa  123  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0792723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2502  acetylornithine deacetylase  29.78 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.11 
 
 		 429 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1722  acetylornithine deacetylase  28.88 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.633386  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.23 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3717  acetylornithine deacetylase  29.79 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1489  peptidase M20  26.51 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0188879  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.07 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1499  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.31 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6159  peptidase M20  32.89 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.757625  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.57 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2177  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.28 
 
 		 441 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0097  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.3 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395035  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01583  acetylornithine deacetylase, hypothetical (Eurofung)  27.96 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.07 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  28.39 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.45 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  28.84 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  25.47 
 
 		 426 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  26.32 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  25.36 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2920  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.9 
 
 		 429 aa  104  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  27.84 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10333  metallopeptidase, putative (JCVI)  26.11 
 
 		 753 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  25.18 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2664  peptidase M20  29.32 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  26.15 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3347  acetylornithine deacetylase  25.95 
 
 		 436 aa  99.8  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.11 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  26.04 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1080  acetylornithine deacetylase  28.06 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.66 
 
 		 395 aa  97.1  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  24.71 
 
 		 426 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.87 
 
 		 399 aa  95.5  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.61 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  26.65 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  26.8 
 
 		 391 aa  94  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.9 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.18 
 
 		 398 aa  93.2  8e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.31 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4506  acetylornithine deacetylase  29.4 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.51 
 
 		 411 aa  91.3  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3265  acetylornithine deacetylase  25.94 
 
 		 416 aa  90.9  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.366543 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  26.56 
 
 		 382 aa  90.5  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.04 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  24.94 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  25.83 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.53 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  27.75 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1406  acetylornithine deacetylase  30.4 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.566514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 		 380 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  27.76 
 
 		 380 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  25.13 
 
 		 378 aa  87  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  25.63 
 
 		 378 aa  87.4  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3737  acetylornithine deacetylase  26.18 
 
 		 427 aa  87  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0792  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  29.61 
 
 		 423 aa  87  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  27.01 
 
 		 382 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2806  peptidase M20  28.1 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0744  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.2 
 
 		 453 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  25.73 
 
 		 388 aa  86.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0080  peptidase M20  27.61 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.306901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  25.87 
 
 		 383 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2875  acetylornithine deacetylase  30.68 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  25.13 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  27.34 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>