130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3542 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3542  peptidase M24  100 
 
 
418 aa  848    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.80746  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1988  Xaa-Pro aminopeptidase-like  59.66 
 
 
453 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0384007  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0829  peptidase M24  34.67 
 
 
415 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0906067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2626  hydrolase/M24 family peptidase  25.81 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000124819  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4527  hydrolase/M24 family peptidase  25.81 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000187713  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  25.83 
 
 
434 aa  60.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5146  methionine aminopeptidase, type I  27.19 
 
 
274 aa  59.7  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  26.1 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1605  peptidase M24  20.79 
 
 
366 aa  57.4  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6603  peptidase M24  25.09 
 
 
373 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  25.61 
 
 
371 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  30.09 
 
 
375 aa  57  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  27 
 
 
259 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  25.21 
 
 
262 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  25.32 
 
 
254 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  27 
 
 
264 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  25.42 
 
 
256 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000632  Xaa-Pro aminopeptidase  24.04 
 
 
395 aa  55.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04935  metallopeptidase  22.26 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  22.61 
 
 
251 aa  53.9  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  27.88 
 
 
418 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  24.47 
 
 
271 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  23.81 
 
 
274 aa  53.1  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  24.76 
 
 
383 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0700  methionine aminopeptidase  23.53 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  25.73 
 
 
259 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2784  peptidase M24  21.8 
 
 
429 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06841  methionine aminopeptidase  26.13 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  24.27 
 
 
449 aa  51.6  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  24.31 
 
 
367 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0269  methionine aminopeptidase, type I  23.14 
 
 
249 aa  51.6  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3303  peptidase M24  26.07 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3046  peptidase M24  23.31 
 
 
404 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  28.33 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  21.77 
 
 
425 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2110  peptidase M24  23.1 
 
 
428 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0590999  normal  0.141965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4474  peptidase M24  22.98 
 
 
415 aa  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.512604  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  25.31 
 
 
254 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21880  Xaa-Pro aminopeptidase  27.9 
 
 
382 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122866  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1744  methionine aminopeptidase, type I  27.92 
 
 
249 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1592  methionine aminopeptidase, type I  26.29 
 
 
248 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2885  methionine aminopeptidase, type I  25.44 
 
 
265 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.100664  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1858  peptidase M24  22.39 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2188  methionine aminopeptidase, type I  28.43 
 
 
265 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.050039  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  22.22 
 
 
353 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0477  methionine aminopeptidase  22.94 
 
 
279 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2238  peptidase M24  24.36 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286205  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1284  methionine aminopeptidase, type I  25.51 
 
 
259 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.222119  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  24.79 
 
 
259 aa  48.1  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  23.04 
 
 
387 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  24.89 
 
 
248 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4913  M24 family metallopeptidase  24.21 
 
 
393 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.804303  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0850  peptidase M24  30.3 
 
 
392 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.877602  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  26.84 
 
 
256 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  23.87 
 
 
280 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  24.02 
 
 
248 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  25.22 
 
 
249 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2374  peptidase M24  29.36 
 
 
376 aa  47.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.429708  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  26.35 
 
 
378 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3120  peptidase M24  21.45 
 
 
380 aa  47.4  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5133  peptidase M24  22.92 
 
 
474 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  20.66 
 
 
357 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0547  peptidase M24  22.55 
 
 
356 aa  47  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.600524  normal  0.382783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28590  putative methionine aminopeptidase  25.11 
 
 
260 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000104352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2186  peptidase M24  26.21 
 
 
396 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0133424  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  23.25 
 
 
336 aa  47  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05321  methionine aminopeptidase  23.38 
 
 
279 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  27.73 
 
 
376 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1815  peptidase M24  26.58 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.254752  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15460  Xaa-Pro aminopeptidase  22.4 
 
 
403 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0971935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  22.07 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  22.07 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3318  peptidase M24  25 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.971608  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  27.57 
 
 
380 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05021  methionine aminopeptidase  22.94 
 
 
279 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  23.17 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3024  peptidase M24  24.51 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.504097  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  24.15 
 
 
251 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  22.07 
 
 
265 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1752  putative creatinase  26.07 
 
 
401 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.485616  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  24.77 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  27.27 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1321  peptidase M24  26.67 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.182533  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  25.43 
 
 
439 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  27.57 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1813  proline dipeptidase  22.09 
 
 
362 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136171  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  27.57 
 
 
380 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05401  methionine aminopeptidase  23.81 
 
 
279 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.12992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  22 
 
 
356 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0928  putative aminopeptidase  20 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.733999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2495  type I methionine aminopeptidase  24.03 
 
 
260 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  25.43 
 
 
251 aa  45.8  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  23.92 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5371  peptidase M24  22.77 
 
 
474 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1630  peptidase M24  23 
 
 
395 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.339878 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  23.46 
 
 
279 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0398  peptidase M24  25.64 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  24.14 
 
 
353 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3693  ectoine utilization protein EutD  22.63 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  24.14 
 
 
353 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>