More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2640 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2633  hypothetical protein  49.87 
 
 		 745 aa  721    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2503  hypothetical protein  49.87 
 
 		 745 aa  718    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1035  transketolase central region  50.85 
 
 		 747 aa  695    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0901  transketolase, central region  49.8 
 
 		 763 aa  678    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.542357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1045  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.46 
 
 		 738 aa  650    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6420  2-oxoisovalerate dehydrogenase  50.61 
 
 		 736 aa  662    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00562183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3017  transketolase, central region  51.83 
 
 		 761 aa  703    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2962  transketolase, central region  49.26 
 
 		 733 aa  670    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0290304  normal  0.0965541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1976  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  51.07 
 
 		 687 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2640  Transketolase domain protein  100 
 
 		 759 aa  1541    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144952  normal  0.326174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2156  transketolase central region  53.47 
 
 		 790 aa  687    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1956  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  50.79 
 
 		 721 aa  656    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2795  transketolase, central region  50.97 
 
 		 761 aa  676    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2022  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  51.07 
 
 		 721 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.556137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3884  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.39 
 
 		 735 aa  633  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2727  transketolase, central region  48.84 
 
 		 727 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.556431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2954  transketolase, central region  47.91 
 
 		 727 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.998903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1294  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  48.08 
 
 		 727 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3610  transketolase domain-containing protein  47.23 
 
 		 805 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3370  transketolase domain-containing protein  47.57 
 
 		 792 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2566  putative bifunctional enzyme  46.13 
 
 		 743 aa  595  1e-168  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000104347  hitchhiker  0.000000000000144647 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0991  dehydrogenase E1 component  31.07 
 
 		 710 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.892178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1786  dehydrogenase, E1 component  28.31 
 
 		 736 aa  219  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0762  transketolase domain-containing protein  29 
 
 		 692 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4110  transketolase domain-containing protein  30.16 
 
 		 692 aa  178  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1538  Transketolase central region  28.15 
 
 		 681 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.244278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05225  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  27.78 
 
 		 688 aa  175  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.737912  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0618  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta subunit  28.08 
 
 		 678 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0587  dehydrogenase E1 component  29.88 
 
 		 680 aa  160  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1604  transketolase, central region  31.22 
 
 		 693 aa  154  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.167534  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3049  transketolase, central region  29.89 
 
 		 617 aa  154  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3123  transketolase domain-containing protein  27.67 
 
 		 701 aa  153  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12518  pyruvate dehydrogenase E1 component beta subunit pdhB  33.93 
 
 		 348 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0826  Transketolase central region  32.91 
 
 		 327 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1154  transketolase domain-containing protein  34.03 
 
 		 325 aa  147  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.113033  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1176  transketolase domain-containing protein  34.03 
 
 		 325 aa  147  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.210987  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2565  transketolase, central region  33.73 
 
 		 354 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.430096  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0456  Transketolase central region  32.93 
 
 		 326 aa  144  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1549  Transketolase domain protein  28.83 
 
 		 709 aa  144  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0681  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  33.03 
 
 		 325 aa  142  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0903  Transketolase central region  33.93 
 
 		 325 aa  142  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.700297  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10943  putative oxidoreductase  26.06 
 
 		 668 aa  141  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.345452  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3318  Transketolase central region  32.02 
 
 		 320 aa  140  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5002  Transketolase central region  36.62 
 
 		 325 aa  140  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00992852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2673  transketolase central region  32.13 
 
 		 325 aa  140  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000190408  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0050  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  32.8 
 
 		 326 aa  140  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0824  Transketolase central region  32.93 
 
 		 326 aa  139  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.862556  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0808  dehydrogenase E1 component  25.87 
 
 		 659 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.222813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1833  Transketolase central region  32.43 
 
 		 325 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3183  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E1 component, alpha and beta fusion  24.96 
 
 		 659 aa  138  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.954931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3377  Transketolase central region  31.78 
 
 		 326 aa  138  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1188  transketolase, central region  32.27 
 
 		 322 aa  137  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.489911  normal  0.0419885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4020  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  32.23 
 
 		 325 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3882  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  32.23 
 
 		 325 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.519915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3714  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  32.23 
 
 		 325 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3730  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  32.23 
 
 		 325 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4183  pyruvate dehydrogenase complex E1 component subunit beta  32.23 
 
 		 325 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4090  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  32.23 
 
 		 325 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000784297  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1330  transketolase, central region  31.48 
 
 		 343 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0296032  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3986  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  32.23 
 
 		 325 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2328  transketolase, central region  32.7 
 
 		 325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2592  transketolase central region  34.53 
 
 		 327 aa  136  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4074  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  32.23 
 
 		 325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.170303  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1404  transketolase, central region  32.16 
 
 		 330 aa  135  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0127505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3242  Transketolase central region  33.75 
 
 		 339 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0939038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0953  Transketolase central region  31.83 
 
 		 325 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2416  transketolase, central region  33.55 
 
 		 327 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2321  Transketolase central region  32.28 
 
 		 324 aa  135  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2596  dehydrogenase, E1 component  28.15 
 
 		 669 aa  135  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.817741  hitchhiker  0.000871115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1166  pyruvate dehydrogenase complex E1 component, beta subunit  32.23 
 
 		 325 aa  135  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.655374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1710  alpha keto acid dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  32.91 
 
 		 325 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0237639 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2096  Transketolase central region  33.33 
 
 		 327 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3160  Transketolase central region  31.33 
 
 		 325 aa  134  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3798  transketolase central region  31.93 
 
 		 325 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.11122  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3108  transketolase, central region  32.32 
 
 		 326 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1994  transketolase central region  32.81 
 
 		 324 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4758  transketolase, central region  33.23 
 
 		 338 aa  133  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6076  transketolase central region  33.03 
 
 		 326 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507877  normal  0.0309873 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0419  Transketolase central region  25.48 
 
 		 791 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0246116  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2339  transketolase, central region  33.84 
 
 		 340 aa  132  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0026  Transketolase central region  33.14 
 
 		 330 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2144  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.37 
 
 		 341 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.869205 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3895  Transketolase central region  32.82 
 
 		 346 aa  132  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327711  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1486  dehydrogenase E1 component  28.28 
 
 		 657 aa  132  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.004553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3192  transketolase, central region  32.65 
 
 		 370 aa  132  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3062  transketolase central region  32.91 
 
 		 327 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2904  Transketolase central region  31.98 
 
 		 373 aa  131  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1871  transketolase central region  34.94 
 
 		 337 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1596  transketolase central region  34.72 
 
 		 325 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0994447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2239  transketolase central region  33.04 
 
 		 334 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0788664  normal  0.171519 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0460  Transketolase central region  34.19 
 
 		 320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0738  acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit  31.95 
 
 		 326 aa  130  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4085  transketolase, central region  32.85 
 
 		 351 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1975  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase E1 component  31.02 
 
 		 351 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0094  Transketolase central region  32.57 
 
 		 328 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4386  Transketolase central region  33.65 
 
 		 332 aa  129  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2846  transketolase central region  29.25 
 
 		 325 aa  129  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00429271  normal  0.065717 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2098  transketolase, central region  33.23 
 
 		 334 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal  0.234627 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0632  transketolase domain-containing protein  31.89 
 
 		 325 aa  129  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000117768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1244  transketolase, central region  31.38 
 
 		 346 aa  129  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.974507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>