More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2312 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2312  Methyltransferase type 11  100 
 
 
275 aa  544  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0759855  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  50.18 
 
 
282 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3362  methyltransferase type 11  51.5 
 
 
282 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0826191  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4212  methyltransferase type 11  51.48 
 
 
282 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4154  methyltransferase type 11  51.48 
 
 
282 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538399  hitchhiker  0.00787832 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4432  methyltransferase type 11  50.92 
 
 
284 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1991  Methyltransferase type 11  50.55 
 
 
283 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.306887  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4043  methyltransferase type 11  51.11 
 
 
282 aa  228  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.197228  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3562  methyltransferase type 11  50 
 
 
282 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122272  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4859  methyltransferase type 11  49.82 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.239817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  43.21 
 
 
280 aa  214  9e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0249  aklanonic acid methyl transferase  47.41 
 
 
291 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.435744  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2695  hypothetical protein  47.41 
 
 
291 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0036  putative methyltransferase  47.41 
 
 
291 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3270  hypothetical protein  47.41 
 
 
291 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1857  hypothetical protein  47.41 
 
 
291 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0036  putative methyltransferase  46.43 
 
 
291 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0034  methyltransferase  47.78 
 
 
305 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2838  methyltransferase type 11  47.69 
 
 
285 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.18 
 
 
285 aa  165  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.01 
 
 
285 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  37.68 
 
 
285 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1032  methyltransferase type 11  37.94 
 
 
282 aa  144  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0822126  normal  0.0891135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1159  Methyltransferase type 11  37.94 
 
 
282 aa  143  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0308306  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2215  methyltransferase type 11  37.28 
 
 
288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0250997  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  40.14 
 
 
287 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0964  Methyltransferase type 11  36.65 
 
 
281 aa  136  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.0015183  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  37.81 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  38.96 
 
 
240 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  36.23 
 
 
283 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5806  Methyltransferase type 11  40.51 
 
 
275 aa  125  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.592498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4627  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.07 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.951338  decreased coverage  0.00842858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  36.8 
 
 
275 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1119  MCP methyltransferase, CheR-type  38.79 
 
 
287 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0868  methyltransferase type 11  35.46 
 
 
285 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321249  hitchhiker  0.00411338 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6294  methyltransferase type 11  36.9 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6529  Methyltransferase type 11  38.08 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0889937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3054  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.81 
 
 
290 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0198479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0533  methyltransferase type 12  31.19 
 
 
325 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  32.35 
 
 
286 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5806  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
281 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1611  methyltransferase type 11  29.07 
 
 
290 aa  99.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.709474  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1612  Methyltransferase type 11  37.58 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227144  normal  0.791841 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6582  Methyltransferase type 11  35.41 
 
 
259 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156331  normal  0.273691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  30.8 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0245  methyltransferase type 11  32.58 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.744046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  28.45 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
266 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  38.81 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1670  methyltransferase type 11  29.59 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1988  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1652  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.74 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.583368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  33.89 
 
 
526 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  34.52 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.67 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 
287 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4254  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.06 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.8 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.31 
 
 
213 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
301 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  35.2 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6455  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.91 
 
 
244 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
252 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
283 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  28.9 
 
 
250 aa  62.4  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  31.86 
 
 
287 aa  62.4  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1100  methyltransferase type 11  33.79 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32.23 
 
 
202 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.22 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5646  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166193  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.59 
 
 
230 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.53 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3846  putative methyltransferase ubiE/COQ5 family  33.14 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
283 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2782  methyltransferase type 11  28.16 
 
 
234 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320592  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
275 aa  60.1  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  27.98 
 
 
299 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  34.06 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31705  predicted protein  30.51 
 
 
163 aa  59.3  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.592624  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  34.06 
 
 
251 aa  59.3  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
272 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  27.53 
 
 
257 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  35.94 
 
 
212 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  34.06 
 
 
251 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.65 
 
 
215 aa  58.9  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.43 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>