250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1750 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  100 
 
 
304 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  72.09 
 
 
322 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  72.09 
 
 
322 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00815  homoserine kinase  73.38 
 
 
294 aa  334  9e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.500035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  43.09 
 
 
311 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  39.93 
 
 
309 aa  222  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  43.38 
 
 
309 aa  210  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  38.87 
 
 
311 aa  186  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  40.32 
 
 
320 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  40 
 
 
320 aa  181  9.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  40.32 
 
 
320 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  42.67 
 
 
314 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  40 
 
 
320 aa  169  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  40.46 
 
 
325 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  40.26 
 
 
320 aa  166  5e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  38.34 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  39.62 
 
 
320 aa  160  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  37.46 
 
 
306 aa  160  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  34.32 
 
 
308 aa  159  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  38.03 
 
 
311 aa  148  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  40.67 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  34.08 
 
 
309 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  33.11 
 
 
328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  34.75 
 
 
309 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  33.76 
 
 
309 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  33.12 
 
 
309 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  33.01 
 
 
309 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  33.01 
 
 
309 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  33.01 
 
 
309 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  33.65 
 
 
309 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  33.65 
 
 
309 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  33.65 
 
 
309 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  33.65 
 
 
309 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  33.33 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  31.73 
 
 
309 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  33.23 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  32.05 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  38.11 
 
 
293 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  31.72 
 
 
309 aa  136  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  30.55 
 
 
314 aa  135  8e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  32.05 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  39.77 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  32.05 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  32.05 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  32.05 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  32.05 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  32.05 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  40.34 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  32.05 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  31.73 
 
 
310 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  37.63 
 
 
296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  31.73 
 
 
310 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  33.87 
 
 
312 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  33.55 
 
 
311 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  33.33 
 
 
318 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  32.18 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  32.11 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  32.08 
 
 
318 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  33.97 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  33.55 
 
 
312 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  33.65 
 
 
312 aa  119  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  32.44 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  33.02 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  33.02 
 
 
312 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  31.27 
 
 
315 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1080  homoserine kinase  34.67 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.708816  normal  0.284936 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  31.71 
 
 
302 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  29.79 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  31.96 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  33.09 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  33.13 
 
 
321 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  31.27 
 
 
315 aa  113  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  34.67 
 
 
316 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  32.8 
 
 
319 aa  112  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2794  homoserine kinase  32.95 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  32.89 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  31.18 
 
 
302 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1272  homoserine kinase  32.82 
 
 
320 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140701  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2739  homoserine kinase  30.19 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11354  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  30.8 
 
 
301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  32.56 
 
 
315 aa  109  5e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  31.01 
 
 
315 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  29.55 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1305  homoserine kinase  31.6 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2734  homoserine kinase  32.82 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0179  homoserine kinase  31.34 
 
 
311 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  30.42 
 
 
301 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  31.73 
 
 
315 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  31.73 
 
 
315 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1228  homoserine kinase  31.29 
 
 
320 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0499672  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2880  homoserine kinase  30.9 
 
 
303 aa  105  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0703126  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10551  homoserine kinase  32.48 
 
 
303 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  29.3 
 
 
312 aa  104  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1018  homoserine kinase  31.64 
 
 
305 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2392  homoserine kinase  37.95 
 
 
326 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1794  homoserine kinase  34.92 
 
 
284 aa  99  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.324471  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  27.12 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  28.25 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  28.24 
 
 
311 aa  96.7  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  25.24 
 
 
300 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>