More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5962 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5962  KpsF/GutQ family protein  100 
 
 
322 aa  655    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3603  KpsF/GutQ family protein  64.81 
 
 
324 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.478278 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0298  KpsF/GutQ family sugar isomerase  56.52 
 
 
322 aa  381  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1665  KpsF/GutQ family protein  56.37 
 
 
320 aa  356  2.9999999999999997e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.309824  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0282  KpsF/GutQ family protein  52.52 
 
 
321 aa  344  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0776  KpsF/GutQ family protein  52.34 
 
 
324 aa  339  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12348  Sugar isomerase, KpsF/GutQ family protein  52.23 
 
 
321 aa  335  9e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2063  KpsF/GutQ family protein  53.11 
 
 
321 aa  333  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.806095  normal  0.101433 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0403  KpsF/GutQ family protein  46.01 
 
 
315 aa  291  9e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18910  KpsF/GutQ family protein  45.63 
 
 
331 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.413862  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2221  KpsF/GutQ family protein  47.95 
 
 
326 aa  286  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1278  KpsF/GutQ  48.89 
 
 
321 aa  285  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000847451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1893  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.89 
 
 
321 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.573226  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1943  arabinose-5-phosphate isomerase  48.73 
 
 
320 aa  281  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0150417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0438  KpsF/GutQ family protein  45.37 
 
 
326 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.181851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0969  KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 
321 aa  279  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0045257  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0763  arabinose-5-phosphate isomerase  48.46 
 
 
324 aa  278  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1202  arabinose-5-phosphate isomerase  48.3 
 
 
324 aa  275  5e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0401  KpsF/GutQ family protein  44.17 
 
 
326 aa  275  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2121  KpsF/GutQ family protein  46.06 
 
 
339 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3339  KpsF/GutQ family protein  49.36 
 
 
326 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0467  KpsF/GutQ  45.54 
 
 
328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2977  KpsF/GutQ family protein  46.35 
 
 
321 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00368361  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1747  KpsF/GutQ  43.87 
 
 
326 aa  271  9e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002407  arabinose 5-phosphate isomerase  43.99 
 
 
323 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.585942  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2104  hypothetical protein  45.11 
 
 
326 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  47.94 
 
 
327 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0875  KpsF/GutQ family protein  46.5 
 
 
324 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2608  KpsF/GutQ family protein  46.52 
 
 
322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0334  KpsF/GutQ family protein  42.81 
 
 
326 aa  266  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1602  KpsF/GutQ family protein  46.2 
 
 
322 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0918  polysialic acid capsule expression protein, KpsF/GutQ family protein  46.08 
 
 
321 aa  265  8e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0957  KpsF/GutQ family protein  46.18 
 
 
324 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0964  KpsF/GutQ family protein  45.86 
 
 
324 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03660  hypothetical protein  42.41 
 
 
323 aa  263  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6051  KpsF/GutQ family protein  44.48 
 
 
333 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1811  KpsF/GutQ family protein  44.23 
 
 
319 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4448  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.82 
 
 
324 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  46.5 
 
 
324 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0182  KpsF/GutQ family protein  49.06 
 
 
330 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0404  KpsF/GutQ family protein  44.55 
 
 
323 aa  262  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.126623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0996  KpsF/GutQ family protein  45.86 
 
 
324 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0154  KpsF/GutQ family protein  44.13 
 
 
333 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0365  KpsF/GutQ family protein  47.04 
 
 
325 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.623237  normal  0.274757 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0746  sugar isomerase, KpsF/GutQ  46.5 
 
 
330 aa  261  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.269497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4142  KpsF/GutQ  46.18 
 
 
324 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0902  hypothetical protein  44.51 
 
 
320 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0871  hypothetical protein  44.51 
 
 
320 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  46.67 
 
 
327 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2171  KpsF/GutQ family protein  46.98 
 
 
322 aa  259  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0413  hypothetical protein  43.81 
 
 
333 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0763573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2710  KpsF/GutQ family protein  45.96 
 
 
329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  44.76 
 
 
357 aa  258  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3490  KpsF/GutQ family protein  47.62 
 
 
333 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4538  KpsF/GutQ family protein  42.06 
 
 
321 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6116  KpsF/GutQ family sugar isomerase  48.25 
 
 
327 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1749  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  43.3 
 
 
319 aa  257  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0491  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  48.25 
 
 
327 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566737  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4132  KpsF/GutQ family protein  47.62 
 
 
333 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57890  hypothetical protein  47.71 
 
 
326 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  47.1 
 
 
329 aa  256  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5030  hypothetical protein  47.39 
 
 
324 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2172  KpsF/GutQ family protein  47.94 
 
 
327 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0436  KpsF/GutQ family protein  42.36 
 
 
326 aa  256  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2786  KpsF/GutQ family protein  47.94 
 
 
327 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.258492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4785  KpsF/GutQ family protein  47.95 
 
 
339 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2704  KpsF/GutQ family protein  47.62 
 
 
327 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0680644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2797  KpsF/GutQ family protein  47.94 
 
 
327 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3652  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.25 
 
 
328 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3810  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.04 
 
 
328 aa  255  6e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0503  KpsF/GutQ family protein  44.34 
 
 
311 aa  255  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0322  KpsF/GutQ family protein  45.13 
 
 
340 aa  255  6e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4362  D-arabinose 5-phosphate isomerase  45.05 
 
 
328 aa  255  6e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.315495  normal  0.179965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3633  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.73 
 
 
328 aa  255  8e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4237  KpsF/GutQ family protein  46.03 
 
 
333 aa  255  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0295  KpsF/GutQ family protein  43.49 
 
 
327 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0862  KpsF/GutQ  45.22 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0213  KpsF/GutQ  42.63 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12840  Arabinose 5-phosphate isomerase protein  44.69 
 
 
344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0446  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.41 
 
 
328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0268  KpsF/GutQ family protein  43.17 
 
 
327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1148  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.41 
 
 
342 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3910  KpsF/GutQ family protein  45.34 
 
 
310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3174  arabinose-5-phosphate isomerase  42.59 
 
 
323 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4898  KpsF/GutQ family protein  44.76 
 
 
335 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340772  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0286  D-arabinose 5-phosphate isomerase  43.77 
 
 
345 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0195424  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0510  D-arabinose 5-phosphate isomerase  44.41 
 
 
357 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0331  KpsF/GutQ family protein  45.71 
 
 
346 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3102  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0770  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2947  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0071  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2846  KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1519  carbohydrate isomerase KpsF/GutQ family protein  47.3 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0586  KpsF/GutQ family sugar isomerase  47.3 
 
 
327 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2110  KpsF/GutQ family protein  44.98 
 
 
332 aa  252  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000613072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0602  KpsF/GutQ family sugar isomerase  47.3 
 
 
327 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0294  arabinose-5-phosphate isomerase  43.32 
 
 
318 aa  251  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5294  KpsF/GutQ family protein  46.5 
 
 
332 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4108  KpsF/GutQ family protein  44.3 
 
 
330 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal  0.0965302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>