More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5479 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3795  tryptophan synthase subunit beta  74.49 
 
 		 399 aa  636    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1827  tryptophan synthase subunit beta  74.17 
 
 		 408 aa  635    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5479  tryptophan synthase, beta subunit  100 
 
 		 399 aa  830    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3024  tryptophan synthase subunit beta  74.36 
 
 		 393 aa  622  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.418532  normal  0.0482136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4896  tryptophan synthase subunit beta  71.54 
 
 		 393 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541071  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06380  tryptophan synthase beta chain  72.05 
 
 		 397 aa  616  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.211017  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3296  tryptophan synthase subunit beta  73.06 
 
 		 398 aa  613  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.801075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1049  tryptophan synthase, beta subunit  58.31 
 
 		 402 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.644397  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0810  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0787  tryptophan synthase subunit beta  60.42 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1911  tryptophan synthase subunit beta  56.86 
 
 		 413 aa  464  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.124597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1668  tryptophan synthase subunit beta  61.15 
 
 		 404 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000103564  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3797  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32688  predicted protein  57.56 
 
 		 417 aa  460  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0289228  normal  0.0344017 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1253  tryptophan synthase subunit beta  57.04 
 
 		 409 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.500519  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1776  tryptophan synthase subunit beta  55.64 
 
 		 413 aa  458  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1249  tryptophan synthase, beta subunit  57.7 
 
 		 409 aa  455  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1749  tryptophan synthase subunit beta  56.52 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2511  tryptophan synthase subunit beta  56.36 
 
 		 413 aa  455  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4724  tryptophan synthase subunit beta  56.92 
 
 		 411 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.319994 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1049  tryptophan synthase subunit beta  58.18 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.548234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1966  tryptophan synthase subunit beta  57.99 
 
 		 411 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0803  tryptophan synthase subunit beta  59.33 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.118728  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2143  tryptophan synthase subunit beta  57.29 
 
 		 420 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0206171  normal  0.237473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0581  tryptophan synthase subunit beta  55.31 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1020  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2125  tryptophan synthase subunit beta  57.62 
 
 		 397 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  decreased coverage  0.00480263 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1297  tryptophan synthase subunit beta  57.64 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.311384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2507  tryptophan synthase subunit beta  56.5 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.050152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2204  tryptophan synthase subunit beta  56.75 
 
 		 406 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.205862  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0827  tryptophan synthase subunit beta  58.66 
 
 		 399 aa  449  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3062  tryptophan synthase subunit beta  57.76 
 
 		 403 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1208  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2726  tryptophan synthase subunit beta  56.19 
 
 		 409 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521455  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1912  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 398 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0679  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 397 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.614528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0392  tryptophan synthase subunit beta  57.47 
 
 		 404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.491733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1698  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.251029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4622  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0491  tryptophan synthase subunit beta  58.75 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4409  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 397 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2157  tryptophan synthase subunit beta  56.88 
 
 		 412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.595682  normal  0.092632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3570  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 397 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3958  tryptophan synthase subunit beta  57.51 
 
 		 397 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  0.187601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2843  tryptophan synthase subunit beta  58.9 
 
 		 405 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0772  tryptophan synthase subunit beta  57.4 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.482746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0529  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1983  tryptophan synthase subunit beta  57.4 
 
 		 403 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00755336 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1721  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0034  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 409 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3853  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2445  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844513  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0769  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0328  tryptophan synthase subunit beta  55.76 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1159  tryptophan synthase subunit beta  56.33 
 
 		 418 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.445238  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4374  tryptophan synthase subunit beta  56.74 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1257  tryptophan synthase beta chain  56.74 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1302  tryptophan synthase subunit beta  55.27 
 
 		 404 aa  441  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.212962  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3887  tryptophan synthase subunit beta  58.02 
 
 		 410 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.85731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2137  tryptophan synthase subunit beta  57.4 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02120  tryptophan synthase subunit beta  56.38 
 
 		 406 aa  441  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1064  tryptophan synthase subunit beta  56.3 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2139  tryptophan synthase subunit beta  57.81 
 
 		 404 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1813  tryptophan synthase subunit beta  57.55 
 
 		 397 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0101  tryptophan synthase subunit beta  56.69 
 
 		 405 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.500434  hitchhiker  0.000655179 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3348  tryptophan synthase subunit beta  57.11 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1511  tryptophan synthase subunit beta  55.3 
 
 		 406 aa  442  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.818044  normal  0.388935 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1858  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.308005  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0591  tryptophan synthase subunit beta  55.76 
 
 		 394 aa  442  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2307  tryptophan synthase subunit beta  56.33 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1649  tryptophan synthase subunit beta  56.07 
 
 		 397 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2763  tryptophan synthase subunit beta  55.53 
 
 		 406 aa  441  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.785331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0083  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 405 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017562 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0245  tryptophan synthase subunit beta  55.5 
 
 		 394 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0098  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 405 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0158  tryptophan synthase, beta subunit  56.38 
 
 		 409 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.994719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0071  tryptophan synthase subunit beta  55.87 
 
 		 411 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1682  tryptophan synthase subunit beta  56.99 
 
 		 428 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2272  tryptophan synthase subunit beta  54.62 
 
 		 413 aa  438  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0535171 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3585  tryptophan synthase subunit beta  57.4 
 
 		 409 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.855143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1864  tryptophan synthase subunit beta  56.22 
 
 		 391 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3270  tryptophan synthase subunit beta  57.4 
 
 		 409 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.244666 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1334  tryptophan synthase, beta subunit  56.1 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.999699  normal  0.825059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2079  tryptophan synthase subunit beta  56.48 
 
 		 403 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2881  tryptophan synthase subunit beta  56.85 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0438165  normal  0.707316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0097  tryptophan synthase subunit beta  55.58 
 
 		 407 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1804  tryptophan synthase subunit beta  56.4 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0038  tryptophan synthase subunit beta  57.59 
 
 		 402 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.206234  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0098  tryptophan synthase subunit beta  56.96 
 
 		 405 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000284084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0143  tryptophan synthase subunit beta  58.35 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00450  tryptophan synthase subunit beta  56.54 
 
 		 402 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.236429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0253  tryptophan synthase subunit beta  57.14 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.208201  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1943  tryptophan synthase subunit beta  58.1 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.233821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1157  tryptophan synthase subunit beta  57.66 
 
 		 395 aa  439  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1656  tryptophan synthase subunit beta  55.24 
 
 		 394 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.483015  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3046  tryptophan synthase subunit beta  57.22 
 
 		 434 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2495  tryptophan synthase subunit beta  54.52 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1141  tryptophan synthase subunit beta  55.93 
 
 		 397 aa  435  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1135  tryptophan synthase subunit beta  55.93 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4048  tryptophan synthase subunit beta  55.93 
 
 		 397 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>