More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5264 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5264  response regulator receiver protein  100 
 
 		 142 aa  298  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5579  response regulator receiver protein  41.26 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7057  response regulator receiver protein  45.08 
 
 		 142 aa  117  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5174  response regulator receiver protein  39.1 
 
 		 135 aa  95.9  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.301225 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2718  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01274  putative two-component response regulator  32.12 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4153  response regulator receiver protein  32.12 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2198  response regulator receiver protein  28.77 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.718868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0315  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7209  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0284  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3821  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.305029  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2409  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2342  response regulator receiver  30.66 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00382381  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2153  response regulator receiver protein  31.21 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0689732  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0424  response regulator receiver protein  31.01 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2131  response regulator receiver protein  34.07 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.159262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2451  response regulator receiver  30.88 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.694561  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0263  response regulator receiver domain-containing protein  43.04 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.132061 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0679  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.145382  normal  0.0176538 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3060  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527476  hitchhiker  0.00457067 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2566  two component signal transduction response regulator  30.07 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  32.37 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1811  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1813  response regulator receiver protein  28.17 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0043  response regulator receiver protein  32.06 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.304768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4269  response regulator receiver protein  30.28 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.306283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0540  response regulator receiver protein  29.58 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0934  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1115  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2912  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1954  response regulator receiver protein  39.76 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  28.15 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1008  response regulator  28.03 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1446  response regulator receiver protein  30.94 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0753  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1192  response regulator receiver domain-containing protein  39.02 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0582118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3218  response regulator receiver domain-containing protein  31.21 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000302211  hitchhiker  0.000261654 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  28.87 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4344  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.676678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5222  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0909  response regulator  35.8 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0381  response regulator  35.8 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1933  response regulator  35.8 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0175  response regulator  35.8 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1433  response regulator  35.8 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.826903  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1843  response regulator  35.8 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.682299  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0473  response regulator  35.8 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  29.84 
 
 		 202 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2262  response regulator receiver protein  38.55 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4416  response regulator receiver protein  35.37 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0554  response regulator receiver protein  31.08 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0974  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0926  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  36.04 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76006  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0036  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1757  response regulator receiver  30.99 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.282821  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3286  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1654  response regulator receiver domain-containing protein  29.37 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00207304  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1869  response regulator receiver protein  28.89 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.124922  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0990  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2298  response regulator receiver domain-containing protein  32.28 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5135  response regulator receiver protein  37.35 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000600577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4953  response regulator receiver protein  32.58 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1229  response regulator receiver protein  34.09 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4420  response regulator receiver protein  31.68 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.390394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2205  response regulator receiver protein  27.46 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0837995  normal  0.255714 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4413  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0271352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4351  response regulator receiver protein  27.66 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2794  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.531019 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  30.48 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1795  response regulator receiver protein  28.26 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.225692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04305  two-component system regulatory protein  28.37 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4644  response regulator receiver protein  32.67 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0382992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0290  response regulator receiver protein  33.73 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000140993  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0176  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4060  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.75 
 
 		 365 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0789  response regulator receiver protein  30.99 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2664  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.213222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0663  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 144 aa  67  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1283  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0282174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0444  response regulator receiver protein  27.74 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3853  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1704  response regulator receiver  30.53 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.635187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1826  response regulator receiver domain-containing protein  27.07 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5035  response regulator receiver protein  32.09 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5581  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2690  response regulator receiver protein  35.8 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0483585  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 944 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2720  response regulator receiver protein  35.8 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.227152  normal  0.416438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2734  response regulator receiver protein  35.8 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192545  normal  0.228442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0449  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4791  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.612255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4150  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1519  response regulator receiver protein  29.23 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4464  response regulator receiver domain-containing protein  39.51 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3340  response regulator receiver protein  27.54 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3011  response regulator receiver protein  32.53 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0415054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>