More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4928 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
234 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.71 
 
 
241 aa  218  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  50.24 
 
 
237 aa  216  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  45.89 
 
 
242 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.52 
 
 
321 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  35.85 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  34.96 
 
 
326 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 
306 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  29.52 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  32.39 
 
 
334 aa  119  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
315 aa  117  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
325 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  33.95 
 
 
349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  34.8 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
311 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
334 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
350 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.68 
 
 
331 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.84 
 
 
313 aa  106  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
324 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
298 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 
308 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
348 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
338 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  28.16 
 
 
313 aa  100  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
341 aa  98.2  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  32.31 
 
 
332 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 
312 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
310 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 
313 aa  95.5  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
310 aa  92  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.32 
 
 
302 aa  91.7  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  32.88 
 
 
339 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  27.44 
 
 
313 aa  87.8  1e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1933  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
1171 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2418  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.319221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2677  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0305483  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
329 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
280 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  40.57 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  40.57 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  29.17 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1346  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.36 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.470467  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  39.62 
 
 
309 aa  75.5  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.63 
 
 
321 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
323 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  26.67 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.78 
 
 
302 aa  73.9  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  26.92 
 
 
332 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  41.41 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  36.3 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.73 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.14 
 
 
329 aa  73.2  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.14 
 
 
254 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4147  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43533 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.64 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
331 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
663 aa  72  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1256  glycosyl transferase family protein  42.71 
 
 
291 aa  72  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.114174  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
581 aa  72  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
321 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1385  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.593757  normal  0.173053 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.35 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  38.04 
 
 
321 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1415  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.41 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1067  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  37.76 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  38.14 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1841  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  36 
 
 
327 aa  69.7  0.00000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1425  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
318 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  27.74 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.98 
 
 
340 aa  68.6  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  39.18 
 
 
380 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  30.43 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
276 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>