More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2318 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  100 
 
 
428 aa  874    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  41.84 
 
 
426 aa  292  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  40.1 
 
 
445 aa  266  5e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  37.76 
 
 
430 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  37.08 
 
 
426 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  36.08 
 
 
444 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  35.63 
 
 
422 aa  245  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  36.02 
 
 
431 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  36.41 
 
 
405 aa  236  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  37.62 
 
 
459 aa  229  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  36.43 
 
 
409 aa  229  9e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  35.01 
 
 
438 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  40.39 
 
 
423 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  36.39 
 
 
428 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  33.99 
 
 
441 aa  223  7e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  35.63 
 
 
426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  34.75 
 
 
431 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  34.46 
 
 
426 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  37.6 
 
 
455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  35.7 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  33.86 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  34.11 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  37.17 
 
 
407 aa  214  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  38.44 
 
 
433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  33.99 
 
 
412 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  36.03 
 
 
417 aa  210  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  36.26 
 
 
430 aa  210  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  34.74 
 
 
408 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  36.46 
 
 
402 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  34.74 
 
 
408 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  34.74 
 
 
408 aa  208  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  33.64 
 
 
432 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  32.86 
 
 
421 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  32.85 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  33.91 
 
 
411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  32.77 
 
 
407 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  35.66 
 
 
433 aa  201  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  35.15 
 
 
419 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  37.6 
 
 
444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  34.99 
 
 
404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  33.91 
 
 
414 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  35.01 
 
 
403 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  34.55 
 
 
434 aa  194  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  34.72 
 
 
402 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  35.22 
 
 
425 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  33.18 
 
 
433 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  35 
 
 
423 aa  187  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  33.24 
 
 
406 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  33.41 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  36.44 
 
 
437 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  32.77 
 
 
429 aa  183  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  34.14 
 
 
425 aa  183  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  33.16 
 
 
424 aa  183  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.69 
 
 
419 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  32.27 
 
 
417 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  32.27 
 
 
417 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  32.27 
 
 
417 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  30.94 
 
 
420 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  33.91 
 
 
407 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  32.1 
 
 
419 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  30.92 
 
 
413 aa  179  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  34.95 
 
 
407 aa  179  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  30.24 
 
 
413 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1275  amidohydrolase  30.71 
 
 
415 aa  177  2e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  33.03 
 
 
444 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  32.06 
 
 
480 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  30.91 
 
 
405 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  33.6 
 
 
416 aa  176  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  30.69 
 
 
413 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  33.1 
 
 
423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  30.69 
 
 
413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  32.01 
 
 
418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  32.28 
 
 
412 aa  172  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  32.81 
 
 
403 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2932  amidohydrolase  31.93 
 
 
431 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  32.54 
 
 
412 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  31.77 
 
 
411 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0293  amidohydrolase  28.91 
 
 
415 aa  169  9e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.356604 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  31.83 
 
 
443 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  29.95 
 
 
436 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  31.44 
 
 
412 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  32.43 
 
 
415 aa  167  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  33.33 
 
 
391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  33 
 
 
408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  30.48 
 
 
415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  31.91 
 
 
470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.01 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  30.89 
 
 
391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  34.1 
 
 
461 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  30.35 
 
 
408 aa  159  6e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 
445 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  31.59 
 
 
400 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  30.46 
 
 
436 aa  156  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  32.35 
 
 
426 aa  156  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  30.62 
 
 
409 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  34.2 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  34.2 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  29.73 
 
 
407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  30 
 
 
486 aa  152  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  29.62 
 
 
405 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>