110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0159 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 310 aa  645    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  79.55 
 
 		 328 aa  532  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  78.1 
 
 		 328 aa  517  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  74.11 
 
 		 342 aa  503  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  69.02 
 
 		 307 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  65.68 
 
 		 303 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  62.12 
 
 		 380 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  55.17 
 
 		 291 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  53.98 
 
 		 287 aa  322  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  43.01 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  43.18 
 
 		 277 aa  232  7.000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  42.86 
 
 		 266 aa  218  7.999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  42.48 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  42.11 
 
 		 267 aa  216  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  41.29 
 
 		 271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  29.62 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  28.74 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  28.52 
 
 		 253 aa  113  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  28.68 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  29.84 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  28.03 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  27.55 
 
 		 253 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  28.02 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  26.95 
 
 		 262 aa  102  7e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  26.7 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  27.67 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  27.27 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  26.72 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  26.67 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  24.54 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  23.44 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  25.45 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  28.92 
 
 		 256 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  22.91 
 
 		 271 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  24.82 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  26.44 
 
 		 270 aa  55.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  27.54 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  32.34 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  23.66 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  27.16 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  22.86 
 
 		 271 aa  53.1  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3243  TatD-related deoxyribonuclease  25.57 
 
 		 282 aa  52.8  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  25.67 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  27.8 
 
 		 256 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  26.27 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3416  TatD-related deoxyribonuclease  26.2 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  27.11 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  28.95 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0329  Aryldialkylphosphatase  25.94 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.369363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  25.11 
 
 		 606 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  29.41 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2682  TatD-related deoxyribonuclease  23.44 
 
 		 265 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292103  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  24.91 
 
 		 464 aa  49.3  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  29.47 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  27.16 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2750  TatD-related deoxyribonuclease  25.83 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  26.53 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  28.48 
 
 		 257 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  25.86 
 
 		 251 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3885  TatD-related deoxyribonuclease  27.51 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  24.39 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  25.11 
 
 		 268 aa  47.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  24.84 
 
 		 454 aa  47  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  21.21 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  21.21 
 
 		 257 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  27.5 
 
 		 255 aa  46.6  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  26.67 
 
 		 259 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  22.38 
 
 		 259 aa  46.6  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  22.94 
 
 		 462 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  23.44 
 
 		 262 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1119  deoxyribonuclease protein  28.06 
 
 		 271 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.209412 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1078  TatD-related deoxyribonuclease  27.55 
 
 		 277 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.013378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  24.36 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  23.74 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  25.48 
 
 		 458 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  28.76 
 
 		 259 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  27.14 
 
 		 462 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  27.03 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2146  TatD family hydrolase  25.62 
 
 		 265 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1857  putative deoxyribonuclease  23.86 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.417967 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  27.75 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  36.05 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  27.17 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  25.72 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  23.47 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0675  putative TatD-related deoxyribonuclease  24.87 
 
 		 265 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0191347  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1938  TatD-related deoxyribonuclease  25.14 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2706  TatD-related deoxyribonuclease  22.93 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.799074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2007  TatD-related deoxyribonuclease  24.88 
 
 		 263 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0669101  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  25.43 
 
 		 461 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  24.39 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  28.91 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  23.27 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  27.17 
 
 		 270 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  24.5 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  23.64 
 
 		 254 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  26.19 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1355  TatD family hydrolase  23.6 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.300834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  23.59 
 
 		 293 aa  43.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  23.41 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>